Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQS8

FYCO1, FYVE and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FYCO1Q9BQS8 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
FYCO1Q9BQS8 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
FYCO1Q9BQS8 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
FYCO1Q9BQS8 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
FYCO1Q9BQS8 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
FYCO1Q9BQS8 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
FYCO1Q9BQS8 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
FYCO1Q9BQS8 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
FYCO1Q9BQS8 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
FYCO1Q9BQS8 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
FYCO1Q9BQS8 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
FYCO1Q9BQS8 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
FYCO1Q9BQS8 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
FYCO1Q9BQS8 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
FYCO1Q9BQS8 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
FYCO1Q9BQS8 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
FYCO1Q9BQS8 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
FYCO1Q9BQS8 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
FYCO1Q9BQS8 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
FYCO1Q9BQS8 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
FYCO1Q9BQS8 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC25.36■■□□□ 1.65
FYCO1Q9BQS8 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
FYCO1Q9BQS8 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
FYCO1Q9BQS8 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
FYCO1Q9BQS8 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
FYCO1Q9BQS8 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
FYCO1Q9BQS8 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
FYCO1Q9BQS8 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
FYCO1Q9BQS8 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
FYCO1Q9BQS8 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
FYCO1Q9BQS8 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
FYCO1Q9BQS8 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC25.35■■□□□ 1.65
FYCO1Q9BQS8 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
FYCO1Q9BQS8 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
FYCO1Q9BQS8 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
FYCO1Q9BQS8 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
FYCO1Q9BQS8 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
FYCO1Q9BQS8 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
FYCO1Q9BQS8 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
FYCO1Q9BQS8 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
FYCO1Q9BQS8 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
FYCO1Q9BQS8 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
FYCO1Q9BQS8 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
FYCO1Q9BQS8 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
FYCO1Q9BQS8 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
FYCO1Q9BQS8 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
FYCO1Q9BQS8 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
FYCO1Q9BQS8 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
FYCO1Q9BQS8 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
FYCO1Q9BQS8 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
FYCO1Q9BQS8 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
FYCO1Q9BQS8 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
FYCO1Q9BQS8 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
FYCO1Q9BQS8 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
FYCO1Q9BQS8 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
FYCO1Q9BQS8 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
FYCO1Q9BQS8 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
FYCO1Q9BQS8 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
FYCO1Q9BQS8 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
FYCO1Q9BQS8 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
FYCO1Q9BQS8 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
FYCO1Q9BQS8 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
FYCO1Q9BQS8 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
FYCO1Q9BQS8 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
FYCO1Q9BQS8 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
FYCO1Q9BQS8 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
FYCO1Q9BQS8 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
FYCO1Q9BQS8 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
FYCO1Q9BQS8 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
FYCO1Q9BQS8 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
FYCO1Q9BQS8 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
FYCO1Q9BQS8 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
FYCO1Q9BQS8 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
FYCO1Q9BQS8 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
FYCO1Q9BQS8 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
FYCO1Q9BQS8 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
FYCO1Q9BQS8 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
FYCO1Q9BQS8 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.34■■□□□ 1.65
FYCO1Q9BQS8 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
FYCO1Q9BQS8 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
FYCO1Q9BQS8 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
FYCO1Q9BQS8 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
FYCO1Q9BQS8 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
FYCO1Q9BQS8 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
FYCO1Q9BQS8 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
FYCO1Q9BQS8 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
FYCO1Q9BQS8 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
FYCO1Q9BQS8 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
FYCO1Q9BQS8 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
FYCO1Q9BQS8 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
FYCO1Q9BQS8 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
FYCO1Q9BQS8 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
FYCO1Q9BQS8 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
FYCO1Q9BQS8 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.33■■□□□ 1.65
FYCO1Q9BQS8 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
FYCO1Q9BQS8 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC25.33■■□□□ 1.65
FYCO1Q9BQS8 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
FYCO1Q9BQS8 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
FYCO1Q9BQS8 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.64
FYCO1Q9BQS8 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.2 ms