Protein–RNA interactions for Protein: Q9BPW4

APOL4, Apolipoprotein L4, humanhuman

Predictions only

Length 351 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOL4Q9BPW4 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
APOL4Q9BPW4 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
APOL4Q9BPW4 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
APOL4Q9BPW4 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
APOL4Q9BPW4 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
APOL4Q9BPW4 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
APOL4Q9BPW4 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
APOL4Q9BPW4 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
APOL4Q9BPW4 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
APOL4Q9BPW4 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
APOL4Q9BPW4 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
APOL4Q9BPW4 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
APOL4Q9BPW4 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
APOL4Q9BPW4 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
APOL4Q9BPW4 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
APOL4Q9BPW4 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
APOL4Q9BPW4 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
APOL4Q9BPW4 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
APOL4Q9BPW4 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
APOL4Q9BPW4 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
APOL4Q9BPW4 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
APOL4Q9BPW4 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
APOL4Q9BPW4 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
APOL4Q9BPW4 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
APOL4Q9BPW4 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
APOL4Q9BPW4 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
APOL4Q9BPW4 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
APOL4Q9BPW4 AC007326.2-201ENST00000624224 7579 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
APOL4Q9BPW4 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
APOL4Q9BPW4 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
APOL4Q9BPW4 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
APOL4Q9BPW4 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
APOL4Q9BPW4 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
APOL4Q9BPW4 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
APOL4Q9BPW4 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
APOL4Q9BPW4 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
APOL4Q9BPW4 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
APOL4Q9BPW4 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
APOL4Q9BPW4 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
APOL4Q9BPW4 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
APOL4Q9BPW4 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
APOL4Q9BPW4 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
APOL4Q9BPW4 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
APOL4Q9BPW4 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
APOL4Q9BPW4 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
APOL4Q9BPW4 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
APOL4Q9BPW4 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
APOL4Q9BPW4 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
APOL4Q9BPW4 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
APOL4Q9BPW4 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
APOL4Q9BPW4 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
APOL4Q9BPW4 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
APOL4Q9BPW4 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
APOL4Q9BPW4 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
APOL4Q9BPW4 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
APOL4Q9BPW4 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
APOL4Q9BPW4 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
APOL4Q9BPW4 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
APOL4Q9BPW4 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
APOL4Q9BPW4 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
APOL4Q9BPW4 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
APOL4Q9BPW4 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
APOL4Q9BPW4 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
APOL4Q9BPW4 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
APOL4Q9BPW4 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
APOL4Q9BPW4 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
APOL4Q9BPW4 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
APOL4Q9BPW4 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
APOL4Q9BPW4 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
APOL4Q9BPW4 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
APOL4Q9BPW4 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
APOL4Q9BPW4 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
APOL4Q9BPW4 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
APOL4Q9BPW4 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
APOL4Q9BPW4 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
APOL4Q9BPW4 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
APOL4Q9BPW4 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
APOL4Q9BPW4 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
APOL4Q9BPW4 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
APOL4Q9BPW4 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
APOL4Q9BPW4 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
APOL4Q9BPW4 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
APOL4Q9BPW4 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
APOL4Q9BPW4 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
APOL4Q9BPW4 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
APOL4Q9BPW4 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
APOL4Q9BPW4 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
APOL4Q9BPW4 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
APOL4Q9BPW4 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
APOL4Q9BPW4 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
APOL4Q9BPW4 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
APOL4Q9BPW4 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
APOL4Q9BPW4 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
APOL4Q9BPW4 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
APOL4Q9BPW4 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
APOL4Q9BPW4 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
APOL4Q9BPW4 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
APOL4Q9BPW4 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
APOL4Q9BPW4 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
APOL4Q9BPW4 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms