Protein–RNA interactions for Protein: Q92576

PHF3, PHD finger protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,039 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF3Q92576 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PHF3Q92576 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PHF3Q92576 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PHF3Q92576 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PHF3Q92576 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PHF3Q92576 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PHF3Q92576 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PHF3Q92576 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PHF3Q92576 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PHF3Q92576 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PHF3Q92576 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PHF3Q92576 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PHF3Q92576 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PHF3Q92576 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PHF3Q92576 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PHF3Q92576 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PHF3Q92576 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PHF3Q92576 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PHF3Q92576 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PHF3Q92576 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PHF3Q92576 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PHF3Q92576 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PHF3Q92576 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
PHF3Q92576 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PHF3Q92576 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PHF3Q92576 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PHF3Q92576 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PHF3Q92576 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PHF3Q92576 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PHF3Q92576 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PHF3Q92576 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PHF3Q92576 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PHF3Q92576 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PHF3Q92576 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PHF3Q92576 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PHF3Q92576 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PHF3Q92576 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PHF3Q92576 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PHF3Q92576 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PHF3Q92576 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PHF3Q92576 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PHF3Q92576 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PHF3Q92576 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
PHF3Q92576 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
PHF3Q92576 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PHF3Q92576 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PHF3Q92576 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PHF3Q92576 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PHF3Q92576 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PHF3Q92576 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
PHF3Q92576 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PHF3Q92576 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PHF3Q92576 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PHF3Q92576 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PHF3Q92576 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PHF3Q92576 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
PHF3Q92576 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PHF3Q92576 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
PHF3Q92576 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PHF3Q92576 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PHF3Q92576 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PHF3Q92576 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PHF3Q92576 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PHF3Q92576 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PHF3Q92576 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PHF3Q92576 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PHF3Q92576 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PHF3Q92576 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PHF3Q92576 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PHF3Q92576 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
PHF3Q92576 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
PHF3Q92576 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PHF3Q92576 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PHF3Q92576 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PHF3Q92576 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
PHF3Q92576 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PHF3Q92576 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
PHF3Q92576 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
PHF3Q92576 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PHF3Q92576 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PHF3Q92576 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PHF3Q92576 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PHF3Q92576 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PHF3Q92576 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PHF3Q92576 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PHF3Q92576 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PHF3Q92576 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PHF3Q92576 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PHF3Q92576 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PHF3Q92576 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PHF3Q92576 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
PHF3Q92576 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PHF3Q92576 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PHF3Q92576 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PHF3Q92576 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PHF3Q92576 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PHF3Q92576 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PHF3Q92576 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PHF3Q92576 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PHF3Q92576 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms