Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUD4

CCDC12, Coiled-coil domain-containing protein 12, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC12Q8WUD4 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC12Q8WUD4 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC12Q8WUD4 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC12Q8WUD4 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC12Q8WUD4 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC12Q8WUD4 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC12Q8WUD4 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC12Q8WUD4 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC12Q8WUD4 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC12Q8WUD4 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC12Q8WUD4 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC12Q8WUD4 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC12Q8WUD4 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC12Q8WUD4 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC12Q8WUD4 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC12Q8WUD4 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC12Q8WUD4 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC12Q8WUD4 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC12Q8WUD4 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC12Q8WUD4 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC12Q8WUD4 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC12Q8WUD4 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC12Q8WUD4 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC12Q8WUD4 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC12Q8WUD4 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC12Q8WUD4 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC12Q8WUD4 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC12Q8WUD4 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC12Q8WUD4 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC12Q8WUD4 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC12Q8WUD4 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC12Q8WUD4 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC12Q8WUD4 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC12Q8WUD4 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC12Q8WUD4 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC12Q8WUD4 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC12Q8WUD4 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC12Q8WUD4 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC12Q8WUD4 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC12Q8WUD4 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC12Q8WUD4 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC12Q8WUD4 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC12Q8WUD4 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC12Q8WUD4 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC12Q8WUD4 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC12Q8WUD4 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC12Q8WUD4 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC12Q8WUD4 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC12Q8WUD4 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC12Q8WUD4 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC12Q8WUD4 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC12Q8WUD4 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC12Q8WUD4 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC12Q8WUD4 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC12Q8WUD4 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC12Q8WUD4 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC12Q8WUD4 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC12Q8WUD4 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC12Q8WUD4 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC12Q8WUD4 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC12Q8WUD4 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC12Q8WUD4 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC12Q8WUD4 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC12Q8WUD4 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC12Q8WUD4 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC12Q8WUD4 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC12Q8WUD4 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC12Q8WUD4 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC12Q8WUD4 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC12Q8WUD4 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC12Q8WUD4 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC12Q8WUD4 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC12Q8WUD4 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC12Q8WUD4 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC12Q8WUD4 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC12Q8WUD4 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC12Q8WUD4 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC12Q8WUD4 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC12Q8WUD4 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC12Q8WUD4 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC12Q8WUD4 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC12Q8WUD4 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC12Q8WUD4 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC12Q8WUD4 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC12Q8WUD4 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC12Q8WUD4 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC12Q8WUD4 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC12Q8WUD4 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC12Q8WUD4 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC12Q8WUD4 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC12Q8WUD4 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC12Q8WUD4 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC12Q8WUD4 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC12Q8WUD4 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC12Q8WUD4 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC12Q8WUD4 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC12Q8WUD4 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC12Q8WUD4 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC12Q8WUD4 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC12Q8WUD4 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.4 ms