Protein–RNA interactions for Protein: Q8TAT5

NEIL3, Endonuclease 8-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 605 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEIL3Q8TAT5 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NEIL3Q8TAT5 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NEIL3Q8TAT5 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NEIL3Q8TAT5 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NEIL3Q8TAT5 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NEIL3Q8TAT5 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NEIL3Q8TAT5 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NEIL3Q8TAT5 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NEIL3Q8TAT5 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
NEIL3Q8TAT5 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NEIL3Q8TAT5 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NEIL3Q8TAT5 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NEIL3Q8TAT5 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NEIL3Q8TAT5 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NEIL3Q8TAT5 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NEIL3Q8TAT5 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NEIL3Q8TAT5 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NEIL3Q8TAT5 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NEIL3Q8TAT5 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NEIL3Q8TAT5 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NEIL3Q8TAT5 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NEIL3Q8TAT5 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NEIL3Q8TAT5 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NEIL3Q8TAT5 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NEIL3Q8TAT5 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NEIL3Q8TAT5 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NEIL3Q8TAT5 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NEIL3Q8TAT5 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
NEIL3Q8TAT5 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NEIL3Q8TAT5 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NEIL3Q8TAT5 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NEIL3Q8TAT5 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NEIL3Q8TAT5 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
NEIL3Q8TAT5 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NEIL3Q8TAT5 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NEIL3Q8TAT5 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NEIL3Q8TAT5 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NEIL3Q8TAT5 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NEIL3Q8TAT5 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
NEIL3Q8TAT5 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NEIL3Q8TAT5 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NEIL3Q8TAT5 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NEIL3Q8TAT5 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NEIL3Q8TAT5 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NEIL3Q8TAT5 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NEIL3Q8TAT5 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NEIL3Q8TAT5 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NEIL3Q8TAT5 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NEIL3Q8TAT5 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NEIL3Q8TAT5 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NEIL3Q8TAT5 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NEIL3Q8TAT5 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NEIL3Q8TAT5 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NEIL3Q8TAT5 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NEIL3Q8TAT5 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NEIL3Q8TAT5 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NEIL3Q8TAT5 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NEIL3Q8TAT5 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NEIL3Q8TAT5 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NEIL3Q8TAT5 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NEIL3Q8TAT5 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NEIL3Q8TAT5 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NEIL3Q8TAT5 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NEIL3Q8TAT5 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NEIL3Q8TAT5 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NEIL3Q8TAT5 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NEIL3Q8TAT5 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NEIL3Q8TAT5 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NEIL3Q8TAT5 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NEIL3Q8TAT5 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NEIL3Q8TAT5 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NEIL3Q8TAT5 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
NEIL3Q8TAT5 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NEIL3Q8TAT5 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NEIL3Q8TAT5 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NEIL3Q8TAT5 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NEIL3Q8TAT5 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
NEIL3Q8TAT5 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NEIL3Q8TAT5 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NEIL3Q8TAT5 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NEIL3Q8TAT5 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
NEIL3Q8TAT5 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NEIL3Q8TAT5 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NEIL3Q8TAT5 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NEIL3Q8TAT5 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NEIL3Q8TAT5 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NEIL3Q8TAT5 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NEIL3Q8TAT5 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NEIL3Q8TAT5 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
NEIL3Q8TAT5 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NEIL3Q8TAT5 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NEIL3Q8TAT5 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NEIL3Q8TAT5 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NEIL3Q8TAT5 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NEIL3Q8TAT5 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NEIL3Q8TAT5 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NEIL3Q8TAT5 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NEIL3Q8TAT5 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NEIL3Q8TAT5 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NEIL3Q8TAT5 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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