Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEK5

ZNF548, Zinc finger protein 548, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF548Q8NEK5 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZNF548Q8NEK5 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZNF548Q8NEK5 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZNF548Q8NEK5 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZNF548Q8NEK5 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
ZNF548Q8NEK5 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZNF548Q8NEK5 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
ZNF548Q8NEK5 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZNF548Q8NEK5 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZNF548Q8NEK5 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZNF548Q8NEK5 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
ZNF548Q8NEK5 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZNF548Q8NEK5 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZNF548Q8NEK5 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
ZNF548Q8NEK5 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
ZNF548Q8NEK5 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZNF548Q8NEK5 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZNF548Q8NEK5 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZNF548Q8NEK5 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZNF548Q8NEK5 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZNF548Q8NEK5 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZNF548Q8NEK5 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZNF548Q8NEK5 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZNF548Q8NEK5 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZNF548Q8NEK5 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZNF548Q8NEK5 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZNF548Q8NEK5 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZNF548Q8NEK5 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZNF548Q8NEK5 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZNF548Q8NEK5 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZNF548Q8NEK5 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZNF548Q8NEK5 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZNF548Q8NEK5 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZNF548Q8NEK5 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZNF548Q8NEK5 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
ZNF548Q8NEK5 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZNF548Q8NEK5 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZNF548Q8NEK5 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZNF548Q8NEK5 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZNF548Q8NEK5 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZNF548Q8NEK5 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
ZNF548Q8NEK5 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZNF548Q8NEK5 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZNF548Q8NEK5 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZNF548Q8NEK5 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZNF548Q8NEK5 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZNF548Q8NEK5 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZNF548Q8NEK5 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZNF548Q8NEK5 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZNF548Q8NEK5 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZNF548Q8NEK5 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZNF548Q8NEK5 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZNF548Q8NEK5 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
ZNF548Q8NEK5 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
ZNF548Q8NEK5 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
ZNF548Q8NEK5 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZNF548Q8NEK5 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZNF548Q8NEK5 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZNF548Q8NEK5 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
ZNF548Q8NEK5 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZNF548Q8NEK5 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZNF548Q8NEK5 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZNF548Q8NEK5 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZNF548Q8NEK5 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZNF548Q8NEK5 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZNF548Q8NEK5 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
ZNF548Q8NEK5 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZNF548Q8NEK5 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZNF548Q8NEK5 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZNF548Q8NEK5 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZNF548Q8NEK5 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZNF548Q8NEK5 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZNF548Q8NEK5 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZNF548Q8NEK5 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZNF548Q8NEK5 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZNF548Q8NEK5 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZNF548Q8NEK5 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZNF548Q8NEK5 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZNF548Q8NEK5 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNF548Q8NEK5 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNF548Q8NEK5 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNF548Q8NEK5 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNF548Q8NEK5 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNF548Q8NEK5 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNF548Q8NEK5 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNF548Q8NEK5 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNF548Q8NEK5 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNF548Q8NEK5 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNF548Q8NEK5 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNF548Q8NEK5 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNF548Q8NEK5 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNF548Q8NEK5 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNF548Q8NEK5 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNF548Q8NEK5 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNF548Q8NEK5 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNF548Q8NEK5 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNF548Q8NEK5 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNF548Q8NEK5 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNF548Q8NEK5 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNF548Q8NEK5 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms