Protein–RNA interactions for Protein: Q86XW9

NME9, Thioredoxin domain-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME9Q86XW9 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NME9Q86XW9 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NME9Q86XW9 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NME9Q86XW9 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NME9Q86XW9 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NME9Q86XW9 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NME9Q86XW9 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NME9Q86XW9 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
NME9Q86XW9 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NME9Q86XW9 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NME9Q86XW9 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
NME9Q86XW9 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NME9Q86XW9 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
NME9Q86XW9 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NME9Q86XW9 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NME9Q86XW9 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NME9Q86XW9 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
NME9Q86XW9 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NME9Q86XW9 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NME9Q86XW9 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NME9Q86XW9 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NME9Q86XW9 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NME9Q86XW9 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NME9Q86XW9 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NME9Q86XW9 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NME9Q86XW9 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NME9Q86XW9 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NME9Q86XW9 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NME9Q86XW9 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NME9Q86XW9 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NME9Q86XW9 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NME9Q86XW9 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NME9Q86XW9 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NME9Q86XW9 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NME9Q86XW9 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NME9Q86XW9 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NME9Q86XW9 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NME9Q86XW9 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NME9Q86XW9 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NME9Q86XW9 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
NME9Q86XW9 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NME9Q86XW9 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NME9Q86XW9 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NME9Q86XW9 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
NME9Q86XW9 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NME9Q86XW9 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NME9Q86XW9 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NME9Q86XW9 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NME9Q86XW9 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NME9Q86XW9 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NME9Q86XW9 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NME9Q86XW9 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NME9Q86XW9 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NME9Q86XW9 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NME9Q86XW9 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NME9Q86XW9 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NME9Q86XW9 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NME9Q86XW9 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NME9Q86XW9 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NME9Q86XW9 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NME9Q86XW9 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NME9Q86XW9 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NME9Q86XW9 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NME9Q86XW9 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NME9Q86XW9 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NME9Q86XW9 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
NME9Q86XW9 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NME9Q86XW9 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NME9Q86XW9 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NME9Q86XW9 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NME9Q86XW9 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NME9Q86XW9 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NME9Q86XW9 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NME9Q86XW9 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NME9Q86XW9 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NME9Q86XW9 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NME9Q86XW9 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NME9Q86XW9 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NME9Q86XW9 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NME9Q86XW9 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NME9Q86XW9 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NME9Q86XW9 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NME9Q86XW9 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NME9Q86XW9 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NME9Q86XW9 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NME9Q86XW9 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NME9Q86XW9 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NME9Q86XW9 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NME9Q86XW9 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NME9Q86XW9 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NME9Q86XW9 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NME9Q86XW9 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NME9Q86XW9 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
NME9Q86XW9 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NME9Q86XW9 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NME9Q86XW9 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NME9Q86XW9 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NME9Q86XW9 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NME9Q86XW9 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NME9Q86XW9 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms