Protein–RNA interactions for Protein: Q86TL0

ATG4D, Cysteine protease ATG4D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4DQ86TL0 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ATG4DQ86TL0 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ATG4DQ86TL0 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ATG4DQ86TL0 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ATG4DQ86TL0 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
ATG4DQ86TL0 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ATG4DQ86TL0 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ATG4DQ86TL0 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ATG4DQ86TL0 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC15.06■□□□□ 0
ATG4DQ86TL0 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC15.06■□□□□ 0
ATG4DQ86TL0 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ATG4DQ86TL0 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ATG4DQ86TL0 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ATG4DQ86TL0 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ATG4DQ86TL0 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ATG4DQ86TL0 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ATG4DQ86TL0 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ATG4DQ86TL0 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ATG4DQ86TL0 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ATG4DQ86TL0 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ATG4DQ86TL0 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ATG4DQ86TL0 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ATG4DQ86TL0 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ATG4DQ86TL0 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ATG4DQ86TL0 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ATG4DQ86TL0 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ATG4DQ86TL0 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ATG4DQ86TL0 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ATG4DQ86TL0 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ATG4DQ86TL0 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ATG4DQ86TL0 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ATG4DQ86TL0 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
ATG4DQ86TL0 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
ATG4DQ86TL0 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ATG4DQ86TL0 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC15.05■□□□□ 0
ATG4DQ86TL0 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ATG4DQ86TL0 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ATG4DQ86TL0 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ATG4DQ86TL0 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
ATG4DQ86TL0 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
ATG4DQ86TL0 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ATG4DQ86TL0 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ATG4DQ86TL0 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ATG4DQ86TL0 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ATG4DQ86TL0 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ATG4DQ86TL0 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ATG4DQ86TL0 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ATG4DQ86TL0 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ATG4DQ86TL0 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ATG4DQ86TL0 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ATG4DQ86TL0 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ATG4DQ86TL0 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC15.05■□□□□ -0
ATG4DQ86TL0 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ATG4DQ86TL0 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ATG4DQ86TL0 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
ATG4DQ86TL0 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
ATG4DQ86TL0 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
ATG4DQ86TL0 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ATG4DQ86TL0 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC15.05■□□□□ -0
ATG4DQ86TL0 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ATG4DQ86TL0 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
ATG4DQ86TL0 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ATG4DQ86TL0 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ATG4DQ86TL0 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ATG4DQ86TL0 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ATG4DQ86TL0 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ATG4DQ86TL0 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ATG4DQ86TL0 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ATG4DQ86TL0 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ATG4DQ86TL0 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ATG4DQ86TL0 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ATG4DQ86TL0 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ATG4DQ86TL0 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ATG4DQ86TL0 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ATG4DQ86TL0 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ATG4DQ86TL0 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ATG4DQ86TL0 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ATG4DQ86TL0 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ATG4DQ86TL0 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ATG4DQ86TL0 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ATG4DQ86TL0 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ATG4DQ86TL0 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ATG4DQ86TL0 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ATG4DQ86TL0 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ATG4DQ86TL0 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ATG4DQ86TL0 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ATG4DQ86TL0 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ATG4DQ86TL0 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ATG4DQ86TL0 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ATG4DQ86TL0 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ATG4DQ86TL0 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ATG4DQ86TL0 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ATG4DQ86TL0 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
ATG4DQ86TL0 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ATG4DQ86TL0 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ATG4DQ86TL0 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ATG4DQ86TL0 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ATG4DQ86TL0 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
ATG4DQ86TL0 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ATG4DQ86TL0 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms