Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3C6

ATG9A, Autophagy-related protein 9A, humanhuman

Predictions only

Length 839 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG9AQ7Z3C6 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATG9AQ7Z3C6 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATG9AQ7Z3C6 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATG9AQ7Z3C6 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATG9AQ7Z3C6 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATG9AQ7Z3C6 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATG9AQ7Z3C6 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATG9AQ7Z3C6 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATG9AQ7Z3C6 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATG9AQ7Z3C6 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATG9AQ7Z3C6 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATG9AQ7Z3C6 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATG9AQ7Z3C6 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATG9AQ7Z3C6 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATG9AQ7Z3C6 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATG9AQ7Z3C6 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
ATG9AQ7Z3C6 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
ATG9AQ7Z3C6 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATG9AQ7Z3C6 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATG9AQ7Z3C6 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATG9AQ7Z3C6 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATG9AQ7Z3C6 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATG9AQ7Z3C6 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATG9AQ7Z3C6 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATG9AQ7Z3C6 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATG9AQ7Z3C6 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATG9AQ7Z3C6 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATG9AQ7Z3C6 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATG9AQ7Z3C6 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATG9AQ7Z3C6 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATG9AQ7Z3C6 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATG9AQ7Z3C6 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATG9AQ7Z3C6 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATG9AQ7Z3C6 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATG9AQ7Z3C6 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATG9AQ7Z3C6 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATG9AQ7Z3C6 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATG9AQ7Z3C6 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATG9AQ7Z3C6 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATG9AQ7Z3C6 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATG9AQ7Z3C6 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
ATG9AQ7Z3C6 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATG9AQ7Z3C6 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATG9AQ7Z3C6 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATG9AQ7Z3C6 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
ATG9AQ7Z3C6 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATG9AQ7Z3C6 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATG9AQ7Z3C6 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATG9AQ7Z3C6 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATG9AQ7Z3C6 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATG9AQ7Z3C6 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATG9AQ7Z3C6 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATG9AQ7Z3C6 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATG9AQ7Z3C6 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATG9AQ7Z3C6 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATG9AQ7Z3C6 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATG9AQ7Z3C6 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATG9AQ7Z3C6 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATG9AQ7Z3C6 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATG9AQ7Z3C6 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATG9AQ7Z3C6 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATG9AQ7Z3C6 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
ATG9AQ7Z3C6 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
ATG9AQ7Z3C6 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
ATG9AQ7Z3C6 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
ATG9AQ7Z3C6 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
ATG9AQ7Z3C6 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATG9AQ7Z3C6 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATG9AQ7Z3C6 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATG9AQ7Z3C6 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATG9AQ7Z3C6 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATG9AQ7Z3C6 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATG9AQ7Z3C6 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATG9AQ7Z3C6 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
ATG9AQ7Z3C6 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATG9AQ7Z3C6 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATG9AQ7Z3C6 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATG9AQ7Z3C6 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATG9AQ7Z3C6 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
ATG9AQ7Z3C6 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATG9AQ7Z3C6 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATG9AQ7Z3C6 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
ATG9AQ7Z3C6 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATG9AQ7Z3C6 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATG9AQ7Z3C6 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATG9AQ7Z3C6 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATG9AQ7Z3C6 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATG9AQ7Z3C6 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATG9AQ7Z3C6 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATG9AQ7Z3C6 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATG9AQ7Z3C6 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATG9AQ7Z3C6 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATG9AQ7Z3C6 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATG9AQ7Z3C6 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATG9AQ7Z3C6 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATG9AQ7Z3C6 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATG9AQ7Z3C6 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATG9AQ7Z3C6 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATG9AQ7Z3C6 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATG9AQ7Z3C6 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms