Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWD8

C16orf54, Transmembrane protein C16orf54, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C16orf54Q6UWD8 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
C16orf54Q6UWD8 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
C16orf54Q6UWD8 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
C16orf54Q6UWD8 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
C16orf54Q6UWD8 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
C16orf54Q6UWD8 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
C16orf54Q6UWD8 SMTN-201ENST00000333137 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
C16orf54Q6UWD8 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC12.91□□□□□ -0.34
C16orf54Q6UWD8 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
C16orf54Q6UWD8 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
C16orf54Q6UWD8 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
C16orf54Q6UWD8 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
C16orf54Q6UWD8 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
C16orf54Q6UWD8 VSIR-201ENST00000394957 4689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
C16orf54Q6UWD8 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
C16orf54Q6UWD8 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
C16orf54Q6UWD8 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
C16orf54Q6UWD8 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
C16orf54Q6UWD8 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
C16orf54Q6UWD8 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
C16orf54Q6UWD8 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
C16orf54Q6UWD8 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
C16orf54Q6UWD8 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
C16orf54Q6UWD8 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
C16orf54Q6UWD8 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
C16orf54Q6UWD8 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
C16orf54Q6UWD8 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
C16orf54Q6UWD8 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
C16orf54Q6UWD8 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
C16orf54Q6UWD8 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
C16orf54Q6UWD8 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
C16orf54Q6UWD8 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
C16orf54Q6UWD8 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
C16orf54Q6UWD8 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
C16orf54Q6UWD8 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
C16orf54Q6UWD8 TRIM17-203ENST00000366697 2652 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
C16orf54Q6UWD8 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
C16orf54Q6UWD8 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
C16orf54Q6UWD8 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
C16orf54Q6UWD8 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
C16orf54Q6UWD8 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
C16orf54Q6UWD8 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
C16orf54Q6UWD8 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
C16orf54Q6UWD8 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
C16orf54Q6UWD8 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
C16orf54Q6UWD8 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
C16orf54Q6UWD8 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
C16orf54Q6UWD8 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
C16orf54Q6UWD8 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
C16orf54Q6UWD8 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
C16orf54Q6UWD8 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
C16orf54Q6UWD8 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
C16orf54Q6UWD8 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
C16orf54Q6UWD8 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
C16orf54Q6UWD8 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
C16orf54Q6UWD8 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
C16orf54Q6UWD8 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
C16orf54Q6UWD8 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
C16orf54Q6UWD8 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
C16orf54Q6UWD8 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
C16orf54Q6UWD8 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
C16orf54Q6UWD8 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
C16orf54Q6UWD8 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
C16orf54Q6UWD8 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
C16orf54Q6UWD8 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
C16orf54Q6UWD8 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
C16orf54Q6UWD8 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
C16orf54Q6UWD8 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
C16orf54Q6UWD8 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
C16orf54Q6UWD8 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
C16orf54Q6UWD8 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
C16orf54Q6UWD8 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
C16orf54Q6UWD8 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
C16orf54Q6UWD8 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
C16orf54Q6UWD8 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
C16orf54Q6UWD8 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
C16orf54Q6UWD8 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
C16orf54Q6UWD8 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
C16orf54Q6UWD8 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
C16orf54Q6UWD8 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
C16orf54Q6UWD8 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC12.9□□□□□ -0.35
C16orf54Q6UWD8 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.35
C16orf54Q6UWD8 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
C16orf54Q6UWD8 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
C16orf54Q6UWD8 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
C16orf54Q6UWD8 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
C16orf54Q6UWD8 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
C16orf54Q6UWD8 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
C16orf54Q6UWD8 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
C16orf54Q6UWD8 ZFP36L1-201ENST00000336440 3026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
C16orf54Q6UWD8 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
C16orf54Q6UWD8 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
C16orf54Q6UWD8 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
C16orf54Q6UWD8 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
C16orf54Q6UWD8 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
C16orf54Q6UWD8 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
C16orf54Q6UWD8 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
C16orf54Q6UWD8 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
C16orf54Q6UWD8 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
C16orf54Q6UWD8 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.9 ms