Protein–RNA interactions for Protein: Q5U3C3

TMEM164, Transmembrane protein 164, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM164Q5U3C3 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM164Q5U3C3 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM164Q5U3C3 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM164Q5U3C3 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM164Q5U3C3 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM164Q5U3C3 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM164Q5U3C3 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM164Q5U3C3 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM164Q5U3C3 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM164Q5U3C3 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM164Q5U3C3 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM164Q5U3C3 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM164Q5U3C3 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM164Q5U3C3 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM164Q5U3C3 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM164Q5U3C3 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM164Q5U3C3 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM164Q5U3C3 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM164Q5U3C3 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM164Q5U3C3 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM164Q5U3C3 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM164Q5U3C3 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM164Q5U3C3 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM164Q5U3C3 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM164Q5U3C3 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM164Q5U3C3 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM164Q5U3C3 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM164Q5U3C3 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM164Q5U3C3 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM164Q5U3C3 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM164Q5U3C3 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM164Q5U3C3 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM164Q5U3C3 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM164Q5U3C3 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM164Q5U3C3 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM164Q5U3C3 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM164Q5U3C3 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM164Q5U3C3 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM164Q5U3C3 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM164Q5U3C3 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM164Q5U3C3 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM164Q5U3C3 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM164Q5U3C3 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM164Q5U3C3 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM164Q5U3C3 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM164Q5U3C3 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM164Q5U3C3 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM164Q5U3C3 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM164Q5U3C3 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM164Q5U3C3 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM164Q5U3C3 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM164Q5U3C3 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TMEM164Q5U3C3 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
TMEM164Q5U3C3 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
TMEM164Q5U3C3 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TMEM164Q5U3C3 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TMEM164Q5U3C3 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TMEM164Q5U3C3 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TMEM164Q5U3C3 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TMEM164Q5U3C3 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TMEM164Q5U3C3 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMEM164Q5U3C3 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMEM164Q5U3C3 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMEM164Q5U3C3 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMEM164Q5U3C3 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMEM164Q5U3C3 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMEM164Q5U3C3 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMEM164Q5U3C3 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMEM164Q5U3C3 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMEM164Q5U3C3 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMEM164Q5U3C3 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMEM164Q5U3C3 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMEM164Q5U3C3 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMEM164Q5U3C3 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
TMEM164Q5U3C3 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMEM164Q5U3C3 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
TMEM164Q5U3C3 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMEM164Q5U3C3 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
TMEM164Q5U3C3 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMEM164Q5U3C3 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMEM164Q5U3C3 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMEM164Q5U3C3 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
TMEM164Q5U3C3 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMEM164Q5U3C3 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
TMEM164Q5U3C3 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMEM164Q5U3C3 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMEM164Q5U3C3 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMEM164Q5U3C3 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMEM164Q5U3C3 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMEM164Q5U3C3 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMEM164Q5U3C3 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMEM164Q5U3C3 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMEM164Q5U3C3 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMEM164Q5U3C3 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMEM164Q5U3C3 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMEM164Q5U3C3 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMEM164Q5U3C3 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMEM164Q5U3C3 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMEM164Q5U3C3 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMEM164Q5U3C3 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.9 ms