Protein–RNA interactions for Protein: Q2VYF4

LETM2, LETM1 domain-containing protein LETM2, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 491 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LETM2Q2VYF4 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
LETM2Q2VYF4 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
LETM2Q2VYF4 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
LETM2Q2VYF4 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
LETM2Q2VYF4 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
LETM2Q2VYF4 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
LETM2Q2VYF4 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
LETM2Q2VYF4 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
LETM2Q2VYF4 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
LETM2Q2VYF4 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
LETM2Q2VYF4 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
LETM2Q2VYF4 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
LETM2Q2VYF4 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
LETM2Q2VYF4 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
LETM2Q2VYF4 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
LETM2Q2VYF4 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
LETM2Q2VYF4 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
LETM2Q2VYF4 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
LETM2Q2VYF4 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
LETM2Q2VYF4 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
LETM2Q2VYF4 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
LETM2Q2VYF4 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
LETM2Q2VYF4 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
LETM2Q2VYF4 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
LETM2Q2VYF4 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
LETM2Q2VYF4 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
LETM2Q2VYF4 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC18.88■□□□□ 0.61
LETM2Q2VYF4 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
LETM2Q2VYF4 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC18.88■□□□□ 0.61
LETM2Q2VYF4 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
LETM2Q2VYF4 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
LETM2Q2VYF4 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
LETM2Q2VYF4 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
LETM2Q2VYF4 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
LETM2Q2VYF4 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
LETM2Q2VYF4 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
LETM2Q2VYF4 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
LETM2Q2VYF4 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
LETM2Q2VYF4 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
LETM2Q2VYF4 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
LETM2Q2VYF4 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
LETM2Q2VYF4 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
LETM2Q2VYF4 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
LETM2Q2VYF4 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
LETM2Q2VYF4 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
LETM2Q2VYF4 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
LETM2Q2VYF4 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
LETM2Q2VYF4 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
LETM2Q2VYF4 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
LETM2Q2VYF4 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
LETM2Q2VYF4 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
LETM2Q2VYF4 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
LETM2Q2VYF4 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
LETM2Q2VYF4 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
LETM2Q2VYF4 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
LETM2Q2VYF4 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
LETM2Q2VYF4 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
LETM2Q2VYF4 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
LETM2Q2VYF4 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
LETM2Q2VYF4 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
LETM2Q2VYF4 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
LETM2Q2VYF4 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC18.87■□□□□ 0.61
LETM2Q2VYF4 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
LETM2Q2VYF4 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
LETM2Q2VYF4 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
LETM2Q2VYF4 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
LETM2Q2VYF4 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
LETM2Q2VYF4 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
LETM2Q2VYF4 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
LETM2Q2VYF4 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
LETM2Q2VYF4 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
LETM2Q2VYF4 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
LETM2Q2VYF4 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
LETM2Q2VYF4 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
LETM2Q2VYF4 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
LETM2Q2VYF4 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
LETM2Q2VYF4 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
LETM2Q2VYF4 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
LETM2Q2VYF4 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
LETM2Q2VYF4 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
LETM2Q2VYF4 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
LETM2Q2VYF4 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
LETM2Q2VYF4 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
LETM2Q2VYF4 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
LETM2Q2VYF4 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
LETM2Q2VYF4 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
LETM2Q2VYF4 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
LETM2Q2VYF4 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
LETM2Q2VYF4 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
LETM2Q2VYF4 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
LETM2Q2VYF4 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
LETM2Q2VYF4 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
LETM2Q2VYF4 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
LETM2Q2VYF4 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
LETM2Q2VYF4 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
LETM2Q2VYF4 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
LETM2Q2VYF4 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
LETM2Q2VYF4 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
LETM2Q2VYF4 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
LETM2Q2VYF4 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
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