Protein–RNA interactions for Protein: Q15822

CHRNA2, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-2, humanhuman

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Length 529 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA2Q15822 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CHRNA2Q15822 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
CHRNA2Q15822 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CHRNA2Q15822 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CHRNA2Q15822 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CHRNA2Q15822 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CHRNA2Q15822 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CHRNA2Q15822 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CHRNA2Q15822 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CHRNA2Q15822 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CHRNA2Q15822 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
CHRNA2Q15822 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
CHRNA2Q15822 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CHRNA2Q15822 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CHRNA2Q15822 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CHRNA2Q15822 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CHRNA2Q15822 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CHRNA2Q15822 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CHRNA2Q15822 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CHRNA2Q15822 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CHRNA2Q15822 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CHRNA2Q15822 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CHRNA2Q15822 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CHRNA2Q15822 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CHRNA2Q15822 GBGT1-202ENST00000372038 847 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CHRNA2Q15822 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CHRNA2Q15822 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CHRNA2Q15822 C8orf37-AS1-202ENST00000517655 562 ntTSL 4 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CHRNA2Q15822 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CHRNA2Q15822 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CHRNA2Q15822 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CHRNA2Q15822 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CHRNA2Q15822 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CHRNA2Q15822 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
CHRNA2Q15822 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CHRNA2Q15822 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CHRNA2Q15822 PAQR6-214ENST00000613336 1599 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CHRNA2Q15822 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CHRNA2Q15822 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CHRNA2Q15822 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CHRNA2Q15822 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CHRNA2Q15822 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CHRNA2Q15822 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CHRNA2Q15822 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CHRNA2Q15822 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CHRNA2Q15822 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
CHRNA2Q15822 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CHRNA2Q15822 CDKN1A-202ENST00000373711 793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CHRNA2Q15822 NME6-203ENST00000415644 849 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CHRNA2Q15822 H2AFV-206ENST00000437072 589 ntTSL 4 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CHRNA2Q15822 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CHRNA2Q15822 TNNT1-209ENST00000587758 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CHRNA2Q15822 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
CHRNA2Q15822 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
CHRNA2Q15822 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CHRNA2Q15822 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CHRNA2Q15822 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
CHRNA2Q15822 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CHRNA2Q15822 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CHRNA2Q15822 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CHRNA2Q15822 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CHRNA2Q15822 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CHRNA2Q15822 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CHRNA2Q15822 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CHRNA2Q15822 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CHRNA2Q15822 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CHRNA2Q15822 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CHRNA2Q15822 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CHRNA2Q15822 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CHRNA2Q15822 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CHRNA2Q15822 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CHRNA2Q15822 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CHRNA2Q15822 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CHRNA2Q15822 PRM2-201ENST00000241808 680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CHRNA2Q15822 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CHRNA2Q15822 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CHRNA2Q15822 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
CHRNA2Q15822 PRM2-202ENST00000435245 723 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CHRNA2Q15822 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
CHRNA2Q15822 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CHRNA2Q15822 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CHRNA2Q15822 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CHRNA2Q15822 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
CHRNA2Q15822 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CHRNA2Q15822 MIR6869-201ENST00000619434 62 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
CHRNA2Q15822 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CHRNA2Q15822 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CHRNA2Q15822 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CHRNA2Q15822 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CHRNA2Q15822 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CHRNA2Q15822 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CHRNA2Q15822 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CHRNA2Q15822 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CHRNA2Q15822 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CHRNA2Q15822 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CHRNA2Q15822 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CHRNA2Q15822 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CHRNA2Q15822 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CHRNA2Q15822 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CHRNA2Q15822 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
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