Protein–RNA interactions for Protein: Q15628

TRADD, Tumor necrosis factor receptor type 1-associated DEATH domain protein, humanhuman

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Length 312 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRADDQ15628 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRADDQ15628 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRADDQ15628 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRADDQ15628 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRADDQ15628 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRADDQ15628 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRADDQ15628 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRADDQ15628 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRADDQ15628 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRADDQ15628 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRADDQ15628 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRADDQ15628 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRADDQ15628 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRADDQ15628 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRADDQ15628 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
TRADDQ15628 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRADDQ15628 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
TRADDQ15628 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRADDQ15628 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRADDQ15628 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRADDQ15628 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRADDQ15628 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRADDQ15628 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRADDQ15628 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRADDQ15628 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRADDQ15628 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRADDQ15628 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRADDQ15628 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRADDQ15628 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRADDQ15628 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRADDQ15628 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRADDQ15628 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRADDQ15628 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
TRADDQ15628 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRADDQ15628 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRADDQ15628 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRADDQ15628 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRADDQ15628 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRADDQ15628 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRADDQ15628 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRADDQ15628 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRADDQ15628 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRADDQ15628 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRADDQ15628 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRADDQ15628 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRADDQ15628 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRADDQ15628 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRADDQ15628 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRADDQ15628 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRADDQ15628 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRADDQ15628 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRADDQ15628 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRADDQ15628 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRADDQ15628 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRADDQ15628 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRADDQ15628 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRADDQ15628 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC17.21■□□□□ 0.34
TRADDQ15628 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC17.21■□□□□ 0.34
TRADDQ15628 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
TRADDQ15628 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
TRADDQ15628 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
TRADDQ15628 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
TRADDQ15628 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRADDQ15628 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRADDQ15628 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRADDQ15628 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRADDQ15628 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRADDQ15628 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRADDQ15628 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRADDQ15628 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRADDQ15628 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRADDQ15628 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRADDQ15628 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRADDQ15628 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRADDQ15628 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRADDQ15628 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRADDQ15628 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRADDQ15628 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRADDQ15628 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRADDQ15628 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRADDQ15628 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRADDQ15628 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRADDQ15628 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRADDQ15628 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
TRADDQ15628 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRADDQ15628 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRADDQ15628 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRADDQ15628 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRADDQ15628 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRADDQ15628 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRADDQ15628 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRADDQ15628 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
TRADDQ15628 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
TRADDQ15628 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRADDQ15628 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRADDQ15628 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRADDQ15628 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRADDQ15628 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRADDQ15628 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRADDQ15628 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
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