Protein–RNA interactions for Protein: Q15008

PSMD6, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 389 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMD6Q15008 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PSMD6Q15008 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
PSMD6Q15008 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PSMD6Q15008 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.47
PSMD6Q15008 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
PSMD6Q15008 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PSMD6Q15008 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PSMD6Q15008 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PSMD6Q15008 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PSMD6Q15008 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PSMD6Q15008 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PSMD6Q15008 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PSMD6Q15008 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PSMD6Q15008 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PSMD6Q15008 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PSMD6Q15008 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PSMD6Q15008 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PSMD6Q15008 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PSMD6Q15008 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PSMD6Q15008 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
PSMD6Q15008 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PSMD6Q15008 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PSMD6Q15008 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PSMD6Q15008 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PSMD6Q15008 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PSMD6Q15008 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PSMD6Q15008 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PSMD6Q15008 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PSMD6Q15008 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PSMD6Q15008 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PSMD6Q15008 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PSMD6Q15008 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PSMD6Q15008 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PSMD6Q15008 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PSMD6Q15008 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PSMD6Q15008 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PSMD6Q15008 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PSMD6Q15008 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
PSMD6Q15008 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PSMD6Q15008 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PSMD6Q15008 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PSMD6Q15008 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PSMD6Q15008 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PSMD6Q15008 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PSMD6Q15008 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PSMD6Q15008 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PSMD6Q15008 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
PSMD6Q15008 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PSMD6Q15008 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
PSMD6Q15008 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PSMD6Q15008 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PSMD6Q15008 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
PSMD6Q15008 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
PSMD6Q15008 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
PSMD6Q15008 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PSMD6Q15008 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PSMD6Q15008 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
PSMD6Q15008 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
PSMD6Q15008 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC18■□□□□ 0.47
PSMD6Q15008 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC18■□□□□ 0.47
PSMD6Q15008 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC18■□□□□ 0.47
PSMD6Q15008 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PSMD6Q15008 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PSMD6Q15008 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PSMD6Q15008 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PSMD6Q15008 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PSMD6Q15008 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PSMD6Q15008 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PSMD6Q15008 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PSMD6Q15008 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PSMD6Q15008 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PSMD6Q15008 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PSMD6Q15008 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PSMD6Q15008 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PSMD6Q15008 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PSMD6Q15008 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PSMD6Q15008 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PSMD6Q15008 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PSMD6Q15008 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PSMD6Q15008 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PSMD6Q15008 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PSMD6Q15008 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PSMD6Q15008 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PSMD6Q15008 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PSMD6Q15008 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PSMD6Q15008 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PSMD6Q15008 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PSMD6Q15008 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PSMD6Q15008 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
PSMD6Q15008 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
PSMD6Q15008 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
PSMD6Q15008 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PSMD6Q15008 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PSMD6Q15008 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PSMD6Q15008 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PSMD6Q15008 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PSMD6Q15008 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PSMD6Q15008 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PSMD6Q15008 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
PSMD6Q15008 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms