Protein–RNA interactions for Protein: Q14714

SSPN, Sarcospan, humanhuman

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Length 243 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSPNQ14714 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SSPNQ14714 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SSPNQ14714 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SSPNQ14714 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SSPNQ14714 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SSPNQ14714 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SSPNQ14714 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SSPNQ14714 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SSPNQ14714 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SSPNQ14714 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SSPNQ14714 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SSPNQ14714 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SSPNQ14714 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SSPNQ14714 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SSPNQ14714 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SSPNQ14714 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SSPNQ14714 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
SSPNQ14714 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SSPNQ14714 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SSPNQ14714 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SSPNQ14714 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SSPNQ14714 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SSPNQ14714 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
SSPNQ14714 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
SSPNQ14714 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
SSPNQ14714 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SSPNQ14714 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SSPNQ14714 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SSPNQ14714 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SSPNQ14714 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SSPNQ14714 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SSPNQ14714 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SSPNQ14714 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SSPNQ14714 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SSPNQ14714 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SSPNQ14714 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SSPNQ14714 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SSPNQ14714 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SSPNQ14714 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SSPNQ14714 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SSPNQ14714 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SSPNQ14714 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SSPNQ14714 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SSPNQ14714 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SSPNQ14714 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SSPNQ14714 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SSPNQ14714 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SSPNQ14714 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SSPNQ14714 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SSPNQ14714 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SSPNQ14714 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SSPNQ14714 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SSPNQ14714 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SSPNQ14714 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SSPNQ14714 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SSPNQ14714 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SSPNQ14714 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SSPNQ14714 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SSPNQ14714 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SSPNQ14714 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SSPNQ14714 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SSPNQ14714 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SSPNQ14714 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SSPNQ14714 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SSPNQ14714 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SSPNQ14714 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SSPNQ14714 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SSPNQ14714 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
SSPNQ14714 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SSPNQ14714 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SSPNQ14714 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SSPNQ14714 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SSPNQ14714 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SSPNQ14714 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SSPNQ14714 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SSPNQ14714 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SSPNQ14714 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
SSPNQ14714 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SSPNQ14714 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SSPNQ14714 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SSPNQ14714 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SSPNQ14714 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SSPNQ14714 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SSPNQ14714 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SSPNQ14714 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SSPNQ14714 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
SSPNQ14714 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SSPNQ14714 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SSPNQ14714 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SSPNQ14714 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SSPNQ14714 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SSPNQ14714 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SSPNQ14714 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SSPNQ14714 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SSPNQ14714 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SSPNQ14714 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SSPNQ14714 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SSPNQ14714 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SSPNQ14714 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SSPNQ14714 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
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