Protein–RNA interactions for Protein: Q13698

CACNA1S, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, humanhuman

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Length 1,873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1SQ13698 PRM2-201ENST00000241808 680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CACNA1SQ13698 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CACNA1SQ13698 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CACNA1SQ13698 PRM2-202ENST00000435245 723 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CACNA1SQ13698 ROPN1-207ENST00000484329 566 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CACNA1SQ13698 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CACNA1SQ13698 FAM8A2P-201ENST00000528813 1142 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
CACNA1SQ13698 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CACNA1SQ13698 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CACNA1SQ13698 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CACNA1SQ13698 AC135178.3-201ENST00000583963 531 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CACNA1SQ13698 ANKS3-227ENST00000592711 580 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CACNA1SQ13698 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
CACNA1SQ13698 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CACNA1SQ13698 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CACNA1SQ13698 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CACNA1SQ13698 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CACNA1SQ13698 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CACNA1SQ13698 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CACNA1SQ13698 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CACNA1SQ13698 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CACNA1SQ13698 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CACNA1SQ13698 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CACNA1SQ13698 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CACNA1SQ13698 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CACNA1SQ13698 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CACNA1SQ13698 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CACNA1SQ13698 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CACNA1SQ13698 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CACNA1SQ13698 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CACNA1SQ13698 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CACNA1SQ13698 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CACNA1SQ13698 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CACNA1SQ13698 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CACNA1SQ13698 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CACNA1SQ13698 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CACNA1SQ13698 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CACNA1SQ13698 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CACNA1SQ13698 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CACNA1SQ13698 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CACNA1SQ13698 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CACNA1SQ13698 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CACNA1SQ13698 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CACNA1SQ13698 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CACNA1SQ13698 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CACNA1SQ13698 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CACNA1SQ13698 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CACNA1SQ13698 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CACNA1SQ13698 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CACNA1SQ13698 EMC4-201ENST00000249209 852 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CACNA1SQ13698 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CACNA1SQ13698 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CACNA1SQ13698 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CACNA1SQ13698 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CACNA1SQ13698 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CACNA1SQ13698 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CACNA1SQ13698 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CACNA1SQ13698 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CACNA1SQ13698 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
CACNA1SQ13698 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CACNA1SQ13698 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CACNA1SQ13698 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CACNA1SQ13698 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CACNA1SQ13698 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CACNA1SQ13698 TRMT112-201ENST00000308774 561 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CACNA1SQ13698 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CACNA1SQ13698 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
CACNA1SQ13698 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CACNA1SQ13698 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CACNA1SQ13698 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CACNA1SQ13698 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CACNA1SQ13698 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CACNA1SQ13698 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CACNA1SQ13698 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CACNA1SQ13698 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CACNA1SQ13698 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CACNA1SQ13698 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CACNA1SQ13698 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CACNA1SQ13698 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CACNA1SQ13698 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CACNA1SQ13698 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CACNA1SQ13698 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
CACNA1SQ13698 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CACNA1SQ13698 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CACNA1SQ13698 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CACNA1SQ13698 FAM192A-212ENST00000566077 1066 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CACNA1SQ13698 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CACNA1SQ13698 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CACNA1SQ13698 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CACNA1SQ13698 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CACNA1SQ13698 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CACNA1SQ13698 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CACNA1SQ13698 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CACNA1SQ13698 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CACNA1SQ13698 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CACNA1SQ13698 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CACNA1SQ13698 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CACNA1SQ13698 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CACNA1SQ13698 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CACNA1SQ13698 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
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