Protein–RNA interactions for Protein: Q13635

PTCH1, Protein patched homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTCH1Q13635 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTCH1Q13635 CALM1-216ENST00000626705 1341 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTCH1Q13635 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTCH1Q13635 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTCH1Q13635 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTCH1Q13635 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTCH1Q13635 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTCH1Q13635 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PTCH1Q13635 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PTCH1Q13635 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PTCH1Q13635 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PTCH1Q13635 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
PTCH1Q13635 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
PTCH1Q13635 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PTCH1Q13635 H2AFV-206ENST00000437072 589 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PTCH1Q13635 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PTCH1Q13635 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PTCH1Q13635 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PTCH1Q13635 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PTCH1Q13635 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PTCH1Q13635 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PTCH1Q13635 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
PTCH1Q13635 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PTCH1Q13635 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PTCH1Q13635 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PTCH1Q13635 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PTCH1Q13635 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PTCH1Q13635 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTCH1Q13635 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTCH1Q13635 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTCH1Q13635 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTCH1Q13635 PRM2-201ENST00000241808 680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTCH1Q13635 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTCH1Q13635 PRM2-202ENST00000435245 723 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTCH1Q13635 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTCH1Q13635 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTCH1Q13635 AC120498.3-201ENST00000568884 542 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTCH1Q13635 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTCH1Q13635 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTCH1Q13635 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTCH1Q13635 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTCH1Q13635 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTCH1Q13635 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTCH1Q13635 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTCH1Q13635 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTCH1Q13635 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTCH1Q13635 B9D1-209ENST00000477478 1353 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTCH1Q13635 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
PTCH1Q13635 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTCH1Q13635 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTCH1Q13635 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTCH1Q13635 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTCH1Q13635 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTCH1Q13635 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTCH1Q13635 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTCH1Q13635 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTCH1Q13635 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTCH1Q13635 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTCH1Q13635 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTCH1Q13635 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
PTCH1Q13635 OSGIN2-203ENST00000520659 801 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTCH1Q13635 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTCH1Q13635 AC046168.2-201ENST00000560590 875 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTCH1Q13635 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTCH1Q13635 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
PTCH1Q13635 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTCH1Q13635 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTCH1Q13635 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTCH1Q13635 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTCH1Q13635 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTCH1Q13635 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTCH1Q13635 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTCH1Q13635 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTCH1Q13635 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTCH1Q13635 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTCH1Q13635 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTCH1Q13635 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTCH1Q13635 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTCH1Q13635 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTCH1Q13635 TMEM225B-203ENST00000453227 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTCH1Q13635 CD63-208ENST00000549117 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTCH1Q13635 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTCH1Q13635 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
PTCH1Q13635 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTCH1Q13635 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
PTCH1Q13635 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTCH1Q13635 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTCH1Q13635 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTCH1Q13635 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTCH1Q13635 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTCH1Q13635 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTCH1Q13635 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTCH1Q13635 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTCH1Q13635 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTCH1Q13635 Z82214.2-201ENST00000420269 531 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTCH1Q13635 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTCH1Q13635 SNHG12-210ENST00000483436 682 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTCH1Q13635 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTCH1Q13635 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTCH1Q13635 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
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