Protein–RNA interactions for Protein: Q13461

FOXE3, Forkhead box protein E3, humanhuman

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Length 319 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXE3Q13461 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
FOXE3Q13461 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
FOXE3Q13461 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
FOXE3Q13461 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
FOXE3Q13461 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
FOXE3Q13461 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
FOXE3Q13461 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
FOXE3Q13461 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
FOXE3Q13461 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
FOXE3Q13461 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
FOXE3Q13461 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
FOXE3Q13461 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
FOXE3Q13461 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
FOXE3Q13461 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
FOXE3Q13461 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC13.14□□□□□ -0.31
FOXE3Q13461 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
FOXE3Q13461 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
FOXE3Q13461 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
FOXE3Q13461 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
FOXE3Q13461 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
FOXE3Q13461 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
FOXE3Q13461 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
FOXE3Q13461 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
FOXE3Q13461 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
FOXE3Q13461 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
FOXE3Q13461 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
FOXE3Q13461 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
FOXE3Q13461 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
FOXE3Q13461 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
FOXE3Q13461 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
FOXE3Q13461 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
FOXE3Q13461 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
FOXE3Q13461 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
FOXE3Q13461 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
FOXE3Q13461 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
FOXE3Q13461 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
FOXE3Q13461 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
FOXE3Q13461 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
FOXE3Q13461 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
FOXE3Q13461 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
FOXE3Q13461 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
FOXE3Q13461 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
FOXE3Q13461 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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FOXE3Q13461 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
FOXE3Q13461 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
FOXE3Q13461 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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FOXE3Q13461 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
FOXE3Q13461 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
FOXE3Q13461 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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FOXE3Q13461 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
FOXE3Q13461 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
FOXE3Q13461 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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FOXE3Q13461 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC13.13□□□□□ -0.31
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FOXE3Q13461 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
FOXE3Q13461 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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FOXE3Q13461 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
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FOXE3Q13461 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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FOXE3Q13461 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
FOXE3Q13461 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
FOXE3Q13461 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
FOXE3Q13461 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
FOXE3Q13461 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
FOXE3Q13461 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
FOXE3Q13461 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
FOXE3Q13461 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
FOXE3Q13461 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
FOXE3Q13461 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
FOXE3Q13461 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
FOXE3Q13461 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC13.13□□□□□ -0.31
FOXE3Q13461 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
FOXE3Q13461 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
FOXE3Q13461 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
FOXE3Q13461 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
FOXE3Q13461 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
FOXE3Q13461 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
FOXE3Q13461 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
FOXE3Q13461 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
FOXE3Q13461 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
FOXE3Q13461 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
FOXE3Q13461 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
FOXE3Q13461 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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