Protein–RNA interactions for Protein: Q13449

LSAMP, Limbic system-associated membrane protein, humanhuman

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Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSAMPQ13449 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
LSAMPQ13449 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
LSAMPQ13449 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
LSAMPQ13449 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
LSAMPQ13449 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LSAMPQ13449 KIAA0513-207ENST00000567328 1873 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LSAMPQ13449 RLIM-202ENST00000349225 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LSAMPQ13449 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
LSAMPQ13449 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LSAMPQ13449 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LSAMPQ13449 MAP3K12-201ENST00000267079 4319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LSAMPQ13449 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LSAMPQ13449 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LSAMPQ13449 SLC22A12-203ENST00000377572 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LSAMPQ13449 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LSAMPQ13449 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LSAMPQ13449 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LSAMPQ13449 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LSAMPQ13449 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LSAMPQ13449 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LSAMPQ13449 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LSAMPQ13449 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LSAMPQ13449 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LSAMPQ13449 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LSAMPQ13449 DMTN-214ENST00000519907 2658 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LSAMPQ13449 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
LSAMPQ13449 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LSAMPQ13449 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LSAMPQ13449 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LSAMPQ13449 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LSAMPQ13449 NUTM2E-201ENST00000429984 3292 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LSAMPQ13449 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LSAMPQ13449 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LSAMPQ13449 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LSAMPQ13449 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LSAMPQ13449 TJP3-202ENST00000541714 3350 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LSAMPQ13449 GREM1-202ENST00000560830 2648 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LSAMPQ13449 ZFYVE28-211ENST00000515312 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LSAMPQ13449 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LSAMPQ13449 GIPC2-201ENST00000370759 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LSAMPQ13449 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LSAMPQ13449 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LSAMPQ13449 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LSAMPQ13449 COQ7-209ENST00000569127 2575 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LSAMPQ13449 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LSAMPQ13449 PML-208ENST00000436891 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LSAMPQ13449 CCT3-201ENST00000295688 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LSAMPQ13449 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LSAMPQ13449 PBX3-201ENST00000342287 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LSAMPQ13449 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LSAMPQ13449 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LSAMPQ13449 TMUB2-202ENST00000357984 1921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LSAMPQ13449 ADCY7-208ENST00000566433 2535 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LSAMPQ13449 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LSAMPQ13449 TAB1-201ENST00000216160 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LSAMPQ13449 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LSAMPQ13449 CALHM1-201ENST00000329905 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LSAMPQ13449 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LSAMPQ13449 KLHDC8A-202ENST00000367156 3177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LSAMPQ13449 ABR-228ENST00000574437 3196 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LSAMPQ13449 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LSAMPQ13449 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LSAMPQ13449 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LSAMPQ13449 PRMT7-202ENST00000441236 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LSAMPQ13449 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LSAMPQ13449 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LSAMPQ13449 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LSAMPQ13449 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LSAMPQ13449 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LSAMPQ13449 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LSAMPQ13449 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LSAMPQ13449 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LSAMPQ13449 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LSAMPQ13449 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LSAMPQ13449 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LSAMPQ13449 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LSAMPQ13449 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LSAMPQ13449 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
LSAMPQ13449 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LSAMPQ13449 PRKN-204ENST00000366896 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LSAMPQ13449 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LSAMPQ13449 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LSAMPQ13449 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LSAMPQ13449 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LSAMPQ13449 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LSAMPQ13449 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LSAMPQ13449 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LSAMPQ13449 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LSAMPQ13449 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LSAMPQ13449 ARRDC4-201ENST00000268042 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LSAMPQ13449 NUTM2A-202ENST00000381707 3290 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LSAMPQ13449 NUTM2B-203ENST00000429828 3292 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LSAMPQ13449 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LSAMPQ13449 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LSAMPQ13449 DEPTOR-201ENST00000286234 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LSAMPQ13449 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LSAMPQ13449 RFX2-222ENST00000592546 2578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LSAMPQ13449 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LSAMPQ13449 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LSAMPQ13449 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
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