Protein–RNA interactions for Protein: Q13332

PTPRS, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase S, humanhuman

Predictions only

Length 1,948 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRSQ13332 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PTPRSQ13332 AC243960.2-201ENST00000600996 747 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
PTPRSQ13332 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
PTPRSQ13332 AC097634.3-201ENST00000613067 820 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PTPRSQ13332 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PTPRSQ13332 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PTPRSQ13332 AL139099.5-201ENST00000635274 300 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
PTPRSQ13332 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PTPRSQ13332 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PTPRSQ13332 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PTPRSQ13332 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PTPRSQ13332 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PTPRSQ13332 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PTPRSQ13332 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PTPRSQ13332 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PTPRSQ13332 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PTPRSQ13332 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
PTPRSQ13332 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PTPRSQ13332 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PTPRSQ13332 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PTPRSQ13332 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PTPRSQ13332 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PTPRSQ13332 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PTPRSQ13332 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PTPRSQ13332 LAMA4-203ENST00000368638 1061 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PTPRSQ13332 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PTPRSQ13332 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PTPRSQ13332 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PTPRSQ13332 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PTPRSQ13332 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PTPRSQ13332 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PTPRSQ13332 RCN1-210ENST00000532942 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PTPRSQ13332 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PTPRSQ13332 C12orf57-206ENST00000544681 980 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PTPRSQ13332 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PTPRSQ13332 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PTPRSQ13332 LINC00623-205ENST00000621058 767 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PTPRSQ13332 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PTPRSQ13332 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PTPRSQ13332 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PTPRSQ13332 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PTPRSQ13332 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PTPRSQ13332 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PTPRSQ13332 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PTPRSQ13332 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PTPRSQ13332 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
PTPRSQ13332 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
PTPRSQ13332 AC007952.1-202ENST00000399083 1173 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PTPRSQ13332 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PTPRSQ13332 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
PTPRSQ13332 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.37
PTPRSQ13332 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.37
PTPRSQ13332 EMC4-209ENST00000559421 497 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
PTPRSQ13332 AC106017.2-201ENST00000631194 1173 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
PTPRSQ13332 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
PTPRSQ13332 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
PTPRSQ13332 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
PTPRSQ13332 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.37
PTPRSQ13332 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PTPRSQ13332 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PTPRSQ13332 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PTPRSQ13332 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PTPRSQ13332 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PTPRSQ13332 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
PTPRSQ13332 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PTPRSQ13332 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
PTPRSQ13332 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PTPRSQ13332 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PTPRSQ13332 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PTPRSQ13332 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
PTPRSQ13332 CRYGN-205ENST00000491928 698 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PTPRSQ13332 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PTPRSQ13332 C2orf69P2-201ENST00000562032 1123 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
PTPRSQ13332 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PTPRSQ13332 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PTPRSQ13332 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PTPRSQ13332 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PTPRSQ13332 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PTPRSQ13332 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PTPRSQ13332 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PTPRSQ13332 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PTPRSQ13332 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PTPRSQ13332 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PTPRSQ13332 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PTPRSQ13332 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PTPRSQ13332 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PTPRSQ13332 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PTPRSQ13332 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PTPRSQ13332 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
PTPRSQ13332 GLYCTK-203ENST00000461183 889 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PTPRSQ13332 AC106786.2-201ENST00000506859 561 ntTSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PTPRSQ13332 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PTPRSQ13332 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
PTPRSQ13332 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
PTPRSQ13332 ROPN1B-210ENST00000514116 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PTPRSQ13332 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PTPRSQ13332 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
PTPRSQ13332 RAB40B-202ENST00000538809 704 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PTPRSQ13332 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PTPRSQ13332 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms