Protein–RNA interactions for Protein: Q13033

STRN3, Striatin-3, humanhuman

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Length 797 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRN3Q13033 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
STRN3Q13033 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
STRN3Q13033 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
STRN3Q13033 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
STRN3Q13033 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
STRN3Q13033 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
STRN3Q13033 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
STRN3Q13033 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
STRN3Q13033 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
STRN3Q13033 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
STRN3Q13033 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
STRN3Q13033 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
STRN3Q13033 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
STRN3Q13033 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
STRN3Q13033 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
STRN3Q13033 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
STRN3Q13033 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
STRN3Q13033 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
STRN3Q13033 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
STRN3Q13033 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
STRN3Q13033 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
STRN3Q13033 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
STRN3Q13033 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
STRN3Q13033 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
STRN3Q13033 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
STRN3Q13033 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
STRN3Q13033 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
STRN3Q13033 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
STRN3Q13033 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
STRN3Q13033 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
STRN3Q13033 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
STRN3Q13033 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
STRN3Q13033 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
STRN3Q13033 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
STRN3Q13033 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
STRN3Q13033 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
STRN3Q13033 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
STRN3Q13033 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
STRN3Q13033 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
STRN3Q13033 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
STRN3Q13033 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
STRN3Q13033 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
STRN3Q13033 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
STRN3Q13033 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
STRN3Q13033 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
STRN3Q13033 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
STRN3Q13033 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
STRN3Q13033 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
STRN3Q13033 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
STRN3Q13033 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
STRN3Q13033 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
STRN3Q13033 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
STRN3Q13033 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
STRN3Q13033 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
STRN3Q13033 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
STRN3Q13033 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
STRN3Q13033 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
STRN3Q13033 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
STRN3Q13033 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
STRN3Q13033 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
STRN3Q13033 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
STRN3Q13033 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
STRN3Q13033 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
STRN3Q13033 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
STRN3Q13033 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
STRN3Q13033 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
STRN3Q13033 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
STRN3Q13033 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
STRN3Q13033 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
STRN3Q13033 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
STRN3Q13033 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
STRN3Q13033 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
STRN3Q13033 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
STRN3Q13033 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
STRN3Q13033 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
STRN3Q13033 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
STRN3Q13033 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
STRN3Q13033 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
STRN3Q13033 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
STRN3Q13033 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
STRN3Q13033 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
STRN3Q13033 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
STRN3Q13033 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
STRN3Q13033 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
STRN3Q13033 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
STRN3Q13033 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
STRN3Q13033 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
STRN3Q13033 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
STRN3Q13033 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
STRN3Q13033 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
STRN3Q13033 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
STRN3Q13033 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
STRN3Q13033 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
STRN3Q13033 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
STRN3Q13033 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
STRN3Q13033 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
STRN3Q13033 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
STRN3Q13033 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
STRN3Q13033 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
STRN3Q13033 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
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