Protein–RNA interactions for Protein: Q12772

SREBF2, Sterol regulatory element-binding protein 2, humanhuman

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Length 1,141 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SREBF2Q12772 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SREBF2Q12772 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SREBF2Q12772 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SREBF2Q12772 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SREBF2Q12772 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SREBF2Q12772 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SREBF2Q12772 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
SREBF2Q12772 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SREBF2Q12772 ZNF527-203ENST00000483919 1142 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SREBF2Q12772 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SREBF2Q12772 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
SREBF2Q12772 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SREBF2Q12772 AC020911.1-201ENST00000591038 578 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SREBF2Q12772 AC010328.2-201ENST00000597698 1111 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
SREBF2Q12772 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
SREBF2Q12772 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SREBF2Q12772 PPA1-206ENST00000625364 644 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SREBF2Q12772 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SREBF2Q12772 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SREBF2Q12772 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SREBF2Q12772 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SREBF2Q12772 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SREBF2Q12772 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SREBF2Q12772 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SREBF2Q12772 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SREBF2Q12772 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SREBF2Q12772 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SREBF2Q12772 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SREBF2Q12772 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SREBF2Q12772 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SREBF2Q12772 AC099850.1-201ENST00000451775 1338 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SREBF2Q12772 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SREBF2Q12772 HIST1H2AJ-201ENST00000333151 387 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SREBF2Q12772 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SREBF2Q12772 AL592464.1-201ENST00000429389 429 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SREBF2Q12772 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SREBF2Q12772 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SREBF2Q12772 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SREBF2Q12772 IFITM3-202ENST00000526811 543 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SREBF2Q12772 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
SREBF2Q12772 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
SREBF2Q12772 AC079316.1-201ENST00000548397 411 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
SREBF2Q12772 RHOQP1-201ENST00000555758 579 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
SREBF2Q12772 LINC02205-201ENST00000559752 239 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SREBF2Q12772 AC097634.3-201ENST00000613067 820 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SREBF2Q12772 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SREBF2Q12772 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SREBF2Q12772 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SREBF2Q12772 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SREBF2Q12772 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SREBF2Q12772 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SREBF2Q12772 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SREBF2Q12772 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SREBF2Q12772 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SREBF2Q12772 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SREBF2Q12772 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
SREBF2Q12772 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
SREBF2Q12772 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SREBF2Q12772 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SREBF2Q12772 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SREBF2Q12772 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SREBF2Q12772 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SREBF2Q12772 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SREBF2Q12772 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SREBF2Q12772 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SREBF2Q12772 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SREBF2Q12772 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SREBF2Q12772 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SREBF2Q12772 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SREBF2Q12772 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SREBF2Q12772 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SREBF2Q12772 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SREBF2Q12772 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SREBF2Q12772 DYNC1I1-203ENST00000413338 958 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SREBF2Q12772 AC127070.2-201ENST00000424075 555 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SREBF2Q12772 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SREBF2Q12772 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SREBF2Q12772 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SREBF2Q12772 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SREBF2Q12772 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SREBF2Q12772 LGALS9C-215ENST00000584941 1104 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SREBF2Q12772 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SREBF2Q12772 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SREBF2Q12772 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SREBF2Q12772 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
SREBF2Q12772 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SREBF2Q12772 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SREBF2Q12772 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SREBF2Q12772 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SREBF2Q12772 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SREBF2Q12772 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SREBF2Q12772 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SREBF2Q12772 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SREBF2Q12772 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SREBF2Q12772 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SREBF2Q12772 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SREBF2Q12772 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SREBF2Q12772 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SREBF2Q12772 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SREBF2Q12772 RUFY2-202ENST00000342616 983 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
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