Protein–RNA interactions for Protein: Q08397

LOXL1, Lysyl oxidase homolog 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 574 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LOXL1Q08397 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
LOXL1Q08397 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
LOXL1Q08397 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
LOXL1Q08397 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
LOXL1Q08397 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
LOXL1Q08397 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
LOXL1Q08397 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
LOXL1Q08397 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.71□□□□□ -0.21
LOXL1Q08397 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
LOXL1Q08397 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
LOXL1Q08397 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
LOXL1Q08397 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
LOXL1Q08397 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
LOXL1Q08397 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
LOXL1Q08397 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
LOXL1Q08397 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
LOXL1Q08397 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
LOXL1Q08397 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
LOXL1Q08397 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
LOXL1Q08397 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
LOXL1Q08397 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
LOXL1Q08397 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
LOXL1Q08397 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.22
LOXL1Q08397 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
LOXL1Q08397 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
LOXL1Q08397 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
LOXL1Q08397 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
LOXL1Q08397 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
LOXL1Q08397 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
LOXL1Q08397 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
LOXL1Q08397 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
LOXL1Q08397 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
LOXL1Q08397 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
LOXL1Q08397 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
LOXL1Q08397 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
LOXL1Q08397 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
LOXL1Q08397 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
LOXL1Q08397 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
LOXL1Q08397 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
LOXL1Q08397 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
LOXL1Q08397 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
LOXL1Q08397 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
LOXL1Q08397 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
LOXL1Q08397 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
LOXL1Q08397 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
LOXL1Q08397 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
LOXL1Q08397 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
LOXL1Q08397 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
LOXL1Q08397 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
LOXL1Q08397 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
LOXL1Q08397 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
LOXL1Q08397 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
LOXL1Q08397 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
LOXL1Q08397 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
LOXL1Q08397 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
LOXL1Q08397 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
LOXL1Q08397 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
LOXL1Q08397 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
LOXL1Q08397 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
LOXL1Q08397 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
LOXL1Q08397 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
LOXL1Q08397 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
LOXL1Q08397 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
LOXL1Q08397 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
LOXL1Q08397 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
LOXL1Q08397 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
LOXL1Q08397 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
LOXL1Q08397 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
LOXL1Q08397 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
LOXL1Q08397 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
LOXL1Q08397 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
LOXL1Q08397 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
LOXL1Q08397 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
LOXL1Q08397 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
LOXL1Q08397 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
LOXL1Q08397 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
LOXL1Q08397 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
LOXL1Q08397 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
LOXL1Q08397 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
LOXL1Q08397 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
LOXL1Q08397 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
LOXL1Q08397 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
LOXL1Q08397 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
LOXL1Q08397 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
LOXL1Q08397 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
LOXL1Q08397 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
LOXL1Q08397 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
LOXL1Q08397 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
LOXL1Q08397 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
LOXL1Q08397 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
LOXL1Q08397 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
LOXL1Q08397 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
LOXL1Q08397 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
LOXL1Q08397 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
LOXL1Q08397 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
LOXL1Q08397 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
LOXL1Q08397 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
LOXL1Q08397 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
LOXL1Q08397 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
LOXL1Q08397 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.7 ms