Protein–RNA interactions for Protein: Q04771

ACVR1, Activin receptor type-1, humanhuman

Predictions only

Length 509 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACVR1Q04771 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ACVR1Q04771 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ACVR1Q04771 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ACVR1Q04771 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ACVR1Q04771 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ACVR1Q04771 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ACVR1Q04771 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ACVR1Q04771 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ACVR1Q04771 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ACVR1Q04771 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ACVR1Q04771 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ACVR1Q04771 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ACVR1Q04771 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ACVR1Q04771 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ACVR1Q04771 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ACVR1Q04771 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ACVR1Q04771 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
ACVR1Q04771 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ACVR1Q04771 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ACVR1Q04771 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ACVR1Q04771 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ACVR1Q04771 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ACVR1Q04771 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ACVR1Q04771 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ACVR1Q04771 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ACVR1Q04771 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ACVR1Q04771 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ACVR1Q04771 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ACVR1Q04771 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ACVR1Q04771 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ACVR1Q04771 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ACVR1Q04771 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ACVR1Q04771 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ACVR1Q04771 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ACVR1Q04771 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ACVR1Q04771 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ACVR1Q04771 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ACVR1Q04771 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ACVR1Q04771 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ACVR1Q04771 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ACVR1Q04771 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ACVR1Q04771 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ACVR1Q04771 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ACVR1Q04771 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ACVR1Q04771 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ACVR1Q04771 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ACVR1Q04771 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
ACVR1Q04771 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ACVR1Q04771 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ACVR1Q04771 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ACVR1Q04771 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ACVR1Q04771 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
ACVR1Q04771 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ACVR1Q04771 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ACVR1Q04771 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ACVR1Q04771 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ACVR1Q04771 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ACVR1Q04771 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ACVR1Q04771 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ACVR1Q04771 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ACVR1Q04771 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ACVR1Q04771 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ACVR1Q04771 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ACVR1Q04771 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
ACVR1Q04771 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ACVR1Q04771 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ACVR1Q04771 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ACVR1Q04771 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ACVR1Q04771 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ACVR1Q04771 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ACVR1Q04771 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ACVR1Q04771 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ACVR1Q04771 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ACVR1Q04771 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ACVR1Q04771 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
ACVR1Q04771 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ACVR1Q04771 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ACVR1Q04771 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ACVR1Q04771 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ACVR1Q04771 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ACVR1Q04771 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ACVR1Q04771 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ACVR1Q04771 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ACVR1Q04771 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
ACVR1Q04771 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ACVR1Q04771 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
ACVR1Q04771 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ACVR1Q04771 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ACVR1Q04771 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ACVR1Q04771 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ACVR1Q04771 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ACVR1Q04771 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ACVR1Q04771 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ACVR1Q04771 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ACVR1Q04771 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ACVR1Q04771 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ACVR1Q04771 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ACVR1Q04771 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
ACVR1Q04771 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ACVR1Q04771 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms