Protein–RNA interactions for Protein: Q03591

CFHR1, Complement factor H-related protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFHR1Q03591 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CFHR1Q03591 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CFHR1Q03591 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CFHR1Q03591 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CFHR1Q03591 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CFHR1Q03591 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CFHR1Q03591 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CFHR1Q03591 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CFHR1Q03591 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CFHR1Q03591 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CFHR1Q03591 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CFHR1Q03591 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CFHR1Q03591 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CFHR1Q03591 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CFHR1Q03591 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CFHR1Q03591 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CFHR1Q03591 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CFHR1Q03591 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CFHR1Q03591 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CFHR1Q03591 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CFHR1Q03591 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CFHR1Q03591 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CFHR1Q03591 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CFHR1Q03591 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CFHR1Q03591 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CFHR1Q03591 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CFHR1Q03591 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CFHR1Q03591 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CFHR1Q03591 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CFHR1Q03591 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CFHR1Q03591 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CFHR1Q03591 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CFHR1Q03591 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CFHR1Q03591 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CFHR1Q03591 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CFHR1Q03591 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CFHR1Q03591 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CFHR1Q03591 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CFHR1Q03591 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CFHR1Q03591 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CFHR1Q03591 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CFHR1Q03591 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CFHR1Q03591 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CFHR1Q03591 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CFHR1Q03591 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CFHR1Q03591 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CFHR1Q03591 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CFHR1Q03591 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CFHR1Q03591 AC079336.1-201ENST00000583156 420 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CFHR1Q03591 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CFHR1Q03591 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CFHR1Q03591 Six3os1_5.1-201ENST00000611000 271 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CFHR1Q03591 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CFHR1Q03591 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CFHR1Q03591 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CFHR1Q03591 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CFHR1Q03591 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CFHR1Q03591 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CFHR1Q03591 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CFHR1Q03591 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CFHR1Q03591 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CFHR1Q03591 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CFHR1Q03591 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CFHR1Q03591 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CFHR1Q03591 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CFHR1Q03591 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CFHR1Q03591 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CFHR1Q03591 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CFHR1Q03591 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CFHR1Q03591 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CFHR1Q03591 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CFHR1Q03591 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CFHR1Q03591 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CFHR1Q03591 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CFHR1Q03591 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CFHR1Q03591 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CFHR1Q03591 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CFHR1Q03591 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CFHR1Q03591 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CFHR1Q03591 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CFHR1Q03591 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CFHR1Q03591 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CFHR1Q03591 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CFHR1Q03591 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CFHR1Q03591 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CFHR1Q03591 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CFHR1Q03591 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CFHR1Q03591 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CFHR1Q03591 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CFHR1Q03591 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CFHR1Q03591 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CFHR1Q03591 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CFHR1Q03591 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CFHR1Q03591 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CFHR1Q03591 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CFHR1Q03591 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CFHR1Q03591 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CFHR1Q03591 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CFHR1Q03591 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CFHR1Q03591 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.8 ms