Protein–RNA interactions for Protein: Q02742

GCNT1, Beta-1,3-galactosyl-O-glycosyl-glycoprotein beta-1,6-N-acetylglucosaminyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCNT1Q02742 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GCNT1Q02742 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GCNT1Q02742 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
GCNT1Q02742 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GCNT1Q02742 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GCNT1Q02742 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GCNT1Q02742 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GCNT1Q02742 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
GCNT1Q02742 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GCNT1Q02742 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
GCNT1Q02742 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GCNT1Q02742 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GCNT1Q02742 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GCNT1Q02742 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GCNT1Q02742 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GCNT1Q02742 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GCNT1Q02742 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GCNT1Q02742 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
GCNT1Q02742 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GCNT1Q02742 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GCNT1Q02742 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GCNT1Q02742 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GCNT1Q02742 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GCNT1Q02742 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
GCNT1Q02742 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
GCNT1Q02742 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
GCNT1Q02742 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
GCNT1Q02742 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GCNT1Q02742 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GCNT1Q02742 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GCNT1Q02742 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GCNT1Q02742 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
GCNT1Q02742 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GCNT1Q02742 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GCNT1Q02742 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GCNT1Q02742 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GCNT1Q02742 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GCNT1Q02742 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GCNT1Q02742 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GCNT1Q02742 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GCNT1Q02742 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
GCNT1Q02742 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GCNT1Q02742 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GCNT1Q02742 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GCNT1Q02742 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
GCNT1Q02742 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GCNT1Q02742 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GCNT1Q02742 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GCNT1Q02742 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GCNT1Q02742 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GCNT1Q02742 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GCNT1Q02742 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GCNT1Q02742 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GCNT1Q02742 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
GCNT1Q02742 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GCNT1Q02742 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GCNT1Q02742 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GCNT1Q02742 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GCNT1Q02742 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GCNT1Q02742 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GCNT1Q02742 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GCNT1Q02742 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GCNT1Q02742 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GCNT1Q02742 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GCNT1Q02742 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GCNT1Q02742 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GCNT1Q02742 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
GCNT1Q02742 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GCNT1Q02742 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GCNT1Q02742 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GCNT1Q02742 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GCNT1Q02742 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GCNT1Q02742 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GCNT1Q02742 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GCNT1Q02742 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GCNT1Q02742 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GCNT1Q02742 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GCNT1Q02742 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
GCNT1Q02742 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GCNT1Q02742 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GCNT1Q02742 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GCNT1Q02742 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GCNT1Q02742 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GCNT1Q02742 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GCNT1Q02742 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GCNT1Q02742 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GCNT1Q02742 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
GCNT1Q02742 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
GCNT1Q02742 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GCNT1Q02742 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GCNT1Q02742 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
GCNT1Q02742 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GCNT1Q02742 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GCNT1Q02742 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
GCNT1Q02742 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GCNT1Q02742 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GCNT1Q02742 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GCNT1Q02742 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GCNT1Q02742 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GCNT1Q02742 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms