Protein–RNA interactions for Protein: P57735

RAB25, Ras-related protein Rab-25, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB25P57735 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RAB25P57735 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RAB25P57735 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RAB25P57735 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
RAB25P57735 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
RAB25P57735 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RAB25P57735 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
RAB25P57735 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
RAB25P57735 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RAB25P57735 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RAB25P57735 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RAB25P57735 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
RAB25P57735 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
RAB25P57735 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RAB25P57735 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
RAB25P57735 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RAB25P57735 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RAB25P57735 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RAB25P57735 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RAB25P57735 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RAB25P57735 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RAB25P57735 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RAB25P57735 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RAB25P57735 LRRK1-201ENST00000388948 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RAB25P57735 GNAO1-201ENST00000262493 3337 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RAB25P57735 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RAB25P57735 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RAB25P57735 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RAB25P57735 GRK6P1-201ENST00000400595 1711 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
RAB25P57735 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RAB25P57735 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RAB25P57735 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RAB25P57735 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RAB25P57735 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RAB25P57735 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RAB25P57735 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
RAB25P57735 HELZ2-204ENST00000467148 8064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RAB25P57735 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RAB25P57735 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RAB25P57735 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RAB25P57735 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RAB25P57735 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RAB25P57735 CYP1B1-205ENST00000610745 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RAB25P57735 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RAB25P57735 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RAB25P57735 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RAB25P57735 ROCK1-201ENST00000399799 9484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RAB25P57735 TLL1-201ENST00000061240 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RAB25P57735 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RAB25P57735 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RAB25P57735 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
RAB25P57735 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RAB25P57735 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RAB25P57735 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RAB25P57735 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
RAB25P57735 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
RAB25P57735 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RAB25P57735 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
RAB25P57735 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RAB25P57735 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RAB25P57735 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RAB25P57735 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RAB25P57735 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RAB25P57735 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RAB25P57735 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RAB25P57735 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RAB25P57735 SPIDR-201ENST00000297423 3988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RAB25P57735 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RAB25P57735 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RAB25P57735 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RAB25P57735 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RAB25P57735 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RAB25P57735 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RAB25P57735 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RAB25P57735 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RAB25P57735 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RAB25P57735 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RAB25P57735 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RAB25P57735 MIRLET7BHG-203ENST00000435439 2264 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RAB25P57735 CNPY1-203ENST00000636372 2259 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RAB25P57735 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RAB25P57735 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RAB25P57735 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RAB25P57735 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RAB25P57735 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RAB25P57735 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RAB25P57735 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RAB25P57735 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RAB25P57735 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RAB25P57735 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RAB25P57735 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RAB25P57735 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RAB25P57735 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RAB25P57735 TAF5-201ENST00000369839 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RAB25P57735 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RAB25P57735 MBNL1-205ENST00000355460 5941 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RAB25P57735 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RAB25P57735 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RAB25P57735 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RAB25P57735 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.6 ms