Protein–RNA interactions for Protein: P53602

MVD, Diphosphomevalonate decarboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 400 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MVDP53602 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
MVDP53602 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MVDP53602 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MVDP53602 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MVDP53602 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
MVDP53602 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MVDP53602 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MVDP53602 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MVDP53602 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MVDP53602 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MVDP53602 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MVDP53602 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MVDP53602 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MVDP53602 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MVDP53602 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MVDP53602 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MVDP53602 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MVDP53602 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MVDP53602 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MVDP53602 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MVDP53602 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MVDP53602 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MVDP53602 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MVDP53602 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MVDP53602 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MVDP53602 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MVDP53602 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MVDP53602 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MVDP53602 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MVDP53602 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MVDP53602 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
MVDP53602 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MVDP53602 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
MVDP53602 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MVDP53602 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MVDP53602 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MVDP53602 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MVDP53602 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MVDP53602 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MVDP53602 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MVDP53602 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MVDP53602 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MVDP53602 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MVDP53602 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MVDP53602 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MVDP53602 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
MVDP53602 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
MVDP53602 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
MVDP53602 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MVDP53602 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
MVDP53602 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MVDP53602 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MVDP53602 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MVDP53602 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MVDP53602 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MVDP53602 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MVDP53602 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MVDP53602 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MVDP53602 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MVDP53602 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MVDP53602 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MVDP53602 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MVDP53602 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MVDP53602 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MVDP53602 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MVDP53602 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MVDP53602 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MVDP53602 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MVDP53602 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
MVDP53602 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MVDP53602 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MVDP53602 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MVDP53602 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MVDP53602 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MVDP53602 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MVDP53602 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MVDP53602 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MVDP53602 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MVDP53602 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MVDP53602 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MVDP53602 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MVDP53602 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MVDP53602 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MVDP53602 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MVDP53602 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MVDP53602 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MVDP53602 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MVDP53602 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MVDP53602 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MVDP53602 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MVDP53602 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
MVDP53602 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MVDP53602 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MVDP53602 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MVDP53602 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MVDP53602 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MVDP53602 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
MVDP53602 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
MVDP53602 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.06
MVDP53602 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms