Protein–RNA interactions for Protein: P51532

SMARCA4, Transcription activator BRG1, humanhuman

Predictions only

Length 1,647 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA4P51532 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
SMARCA4P51532 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
SMARCA4P51532 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
SMARCA4P51532 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
SMARCA4P51532 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
SMARCA4P51532 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
SMARCA4P51532 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
SMARCA4P51532 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
SMARCA4P51532 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
SMARCA4P51532 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC29.13■■■□□ 2.25
SMARCA4P51532 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
SMARCA4P51532 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
SMARCA4P51532 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
SMARCA4P51532 SETD4-205ENST00000399208 1165 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
SMARCA4P51532 BRWD1P1-201ENST00000401091 371 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
SMARCA4P51532 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
SMARCA4P51532 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC29.12■■■□□ 2.25
SMARCA4P51532 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC29.12■■■□□ 2.25
SMARCA4P51532 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
SMARCA4P51532 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
SMARCA4P51532 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
SMARCA4P51532 MCHR2-202ENST00000369212 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
SMARCA4P51532 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
SMARCA4P51532 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
SMARCA4P51532 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
SMARCA4P51532 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
SMARCA4P51532 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
SMARCA4P51532 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
SMARCA4P51532 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
SMARCA4P51532 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
SMARCA4P51532 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
SMARCA4P51532 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
SMARCA4P51532 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC29.12■■■□□ 2.25
SMARCA4P51532 AL354740.1-203ENST00000593917 424 ntTSL 3 BASIC29.12■■■□□ 2.25
SMARCA4P51532 TMEM106C-201ENST00000256686 1394 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
SMARCA4P51532 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
SMARCA4P51532 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
SMARCA4P51532 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
SMARCA4P51532 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
SMARCA4P51532 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
SMARCA4P51532 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
SMARCA4P51532 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
SMARCA4P51532 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
SMARCA4P51532 CCDC88B-201ENST00000301897 870 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
SMARCA4P51532 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
SMARCA4P51532 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
SMARCA4P51532 MASP2-202ENST00000400898 726 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
SMARCA4P51532 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
SMARCA4P51532 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
SMARCA4P51532 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
SMARCA4P51532 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
SMARCA4P51532 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
SMARCA4P51532 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
SMARCA4P51532 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
SMARCA4P51532 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
SMARCA4P51532 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC29.1■■■□□ 2.25
SMARCA4P51532 CATSPERZ-201ENST00000328404 743 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
SMARCA4P51532 AC127070.2-201ENST00000424075 555 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
SMARCA4P51532 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
SMARCA4P51532 GOLGA2P4-201ENST00000441462 777 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
SMARCA4P51532 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
SMARCA4P51532 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
SMARCA4P51532 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
SMARCA4P51532 AC009093.8-202ENST00000562902 677 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
SMARCA4P51532 DUX4L45-201ENST00000566406 1057 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
SMARCA4P51532 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
SMARCA4P51532 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
SMARCA4P51532 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
SMARCA4P51532 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
SMARCA4P51532 LINC02028-216ENST00000609015 732 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
SMARCA4P51532 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
SMARCA4P51532 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
SMARCA4P51532 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
SMARCA4P51532 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
SMARCA4P51532 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
SMARCA4P51532 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
SMARCA4P51532 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
SMARCA4P51532 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
SMARCA4P51532 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
SMARCA4P51532 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
SMARCA4P51532 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
SMARCA4P51532 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
SMARCA4P51532 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
SMARCA4P51532 CFLAR-203ENST00000341222 1283 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
SMARCA4P51532 GLYCTK-203ENST00000461183 889 ntTSL 3 BASIC29.09■■■□□ 2.25
SMARCA4P51532 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
SMARCA4P51532 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC29.09■■■□□ 2.25
SMARCA4P51532 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
SMARCA4P51532 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
SMARCA4P51532 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
SMARCA4P51532 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
SMARCA4P51532 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
SMARCA4P51532 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
SMARCA4P51532 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
SMARCA4P51532 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
SMARCA4P51532 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
SMARCA4P51532 SPDYE7P-201ENST00000355920 1064 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
SMARCA4P51532 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC29.09■■■□□ 2.25
SMARCA4P51532 AL139289.2-201ENST00000424948 661 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
SMARCA4P51532 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC29.09■■■□□ 2.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms