Protein–RNA interactions for Protein: P46100

ATRX, Transcriptional regulator ATRX, humanhuman

Predictions only

Length 2,492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRXP46100 LGALS3BP-202ENST00000585407 936 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ATRXP46100 MFSD11-218ENST00000591864 446 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ATRXP46100 KC6-205ENST00000599934 556 ntTSL 4 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ATRXP46100 AC097724.1-201ENST00000609581 426 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
ATRXP46100 FDPS-221ENST00000612683 1198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ATRXP46100 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ATRXP46100 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ATRXP46100 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ATRXP46100 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ATRXP46100 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ATRXP46100 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ATRXP46100 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ATRXP46100 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ATRXP46100 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ATRXP46100 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ATRXP46100 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ATRXP46100 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ATRXP46100 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ATRXP46100 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ATRXP46100 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ATRXP46100 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ATRXP46100 GTF2A2-204ENST00000396063 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ATRXP46100 LINC01665-201ENST00000422917 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ATRXP46100 AGTRAP-206ENST00000452018 809 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ATRXP46100 PGRMC2-206ENST00000512483 1144 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ATRXP46100 DYNLRB2-205ENST00000568035 409 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ATRXP46100 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ATRXP46100 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ATRXP46100 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC15□□□□□ -0.01
ATRXP46100 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC15□□□□□ -0.01
ATRXP46100 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
ATRXP46100 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC15□□□□□ -0.01
ATRXP46100 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ATRXP46100 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ATRXP46100 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
ATRXP46100 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
ATRXP46100 CSH2-201ENST00000336844 1173 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
ATRXP46100 CSH2-202ENST00000345366 598 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
ATRXP46100 ASNA1-201ENST00000357332 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ATRXP46100 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
ATRXP46100 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
ATRXP46100 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC15□□□□□ -0.01
ATRXP46100 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15□□□□□ -0.01
ATRXP46100 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
ATRXP46100 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC15□□□□□ -0.01
ATRXP46100 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC15□□□□□ -0.01
ATRXP46100 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
ATRXP46100 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC15□□□□□ -0.01
ATRXP46100 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
ATRXP46100 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
ATRXP46100 AP002360.2-202ENST00000572035 738 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
ATRXP46100 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC15□□□□□ -0.01
ATRXP46100 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ATRXP46100 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ATRXP46100 NDUFB11-202ENST00000377811 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ATRXP46100 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
ATRXP46100 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ATRXP46100 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
ATRXP46100 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ATRXP46100 ATP5H-201ENST00000301587 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ATRXP46100 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
ATRXP46100 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ATRXP46100 IGLC7-201ENST00000390331 441 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
ATRXP46100 PUS10-202ENST00000398658 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ATRXP46100 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
ATRXP46100 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
ATRXP46100 PAQR9-AS1-203ENST00000497652 516 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
ATRXP46100 AC246817.2-203ENST00000517357 569 ntTSL 4 BASIC15□□□□□ -0.01
ATRXP46100 CLNS1A-211ENST00000532069 898 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
ATRXP46100 CX3CL1-203ENST00000564948 563 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
ATRXP46100 SSTR5-AS1-201ENST00000565992 575 ntTSL 4 BASIC15□□□□□ -0.01
ATRXP46100 ZNF586-204ENST00000598183 603 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
ATRXP46100 SRD5A3-AS1-211ENST00000599135 737 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
ATRXP46100 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
ATRXP46100 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
ATRXP46100 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ATRXP46100 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ATRXP46100 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ATRXP46100 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ATRXP46100 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ATRXP46100 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ATRXP46100 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ATRXP46100 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ATRXP46100 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ATRXP46100 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ATRXP46100 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ATRXP46100 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ATRXP46100 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ATRXP46100 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ATRXP46100 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ATRXP46100 MIR326-201ENST00000362220 95 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
ATRXP46100 CTNNBIP1-202ENST00000377258 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ATRXP46100 AL160290.2-201ENST00000448347 831 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ATRXP46100 RBM4B-202ENST00000524637 867 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ATRXP46100 AC124301.1-201ENST00000524885 602 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ATRXP46100 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ATRXP46100 FKBP11-212ENST00000552878 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ATRXP46100 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ATRXP46100 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
ATRXP46100 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms