Protein–RNA interactions for Protein: P42338

PIK3CB, Phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit beta isoform, humanhuman

Predictions only

Length 1,070 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3CBP42338 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PIK3CBP42338 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PIK3CBP42338 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PIK3CBP42338 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PIK3CBP42338 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PIK3CBP42338 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PIK3CBP42338 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PIK3CBP42338 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PIK3CBP42338 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PIK3CBP42338 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PIK3CBP42338 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PIK3CBP42338 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PIK3CBP42338 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PIK3CBP42338 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PIK3CBP42338 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PIK3CBP42338 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PIK3CBP42338 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PIK3CBP42338 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PIK3CBP42338 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PIK3CBP42338 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PIK3CBP42338 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PIK3CBP42338 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PIK3CBP42338 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PIK3CBP42338 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PIK3CBP42338 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PIK3CBP42338 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PIK3CBP42338 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PIK3CBP42338 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PIK3CBP42338 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PIK3CBP42338 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PIK3CBP42338 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PIK3CBP42338 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PIK3CBP42338 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PIK3CBP42338 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PIK3CBP42338 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PIK3CBP42338 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PIK3CBP42338 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PIK3CBP42338 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PIK3CBP42338 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
PIK3CBP42338 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
PIK3CBP42338 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PIK3CBP42338 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PIK3CBP42338 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PIK3CBP42338 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
PIK3CBP42338 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PIK3CBP42338 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
PIK3CBP42338 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PIK3CBP42338 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PIK3CBP42338 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
PIK3CBP42338 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PIK3CBP42338 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PIK3CBP42338 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PIK3CBP42338 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PIK3CBP42338 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PIK3CBP42338 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PIK3CBP42338 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PIK3CBP42338 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PIK3CBP42338 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PIK3CBP42338 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PIK3CBP42338 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PIK3CBP42338 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PIK3CBP42338 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PIK3CBP42338 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PIK3CBP42338 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PIK3CBP42338 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PIK3CBP42338 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PIK3CBP42338 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PIK3CBP42338 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
PIK3CBP42338 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PIK3CBP42338 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PIK3CBP42338 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PIK3CBP42338 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PIK3CBP42338 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PIK3CBP42338 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PIK3CBP42338 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PIK3CBP42338 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PIK3CBP42338 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PIK3CBP42338 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PIK3CBP42338 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PIK3CBP42338 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PIK3CBP42338 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PIK3CBP42338 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PIK3CBP42338 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PIK3CBP42338 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PIK3CBP42338 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
PIK3CBP42338 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PIK3CBP42338 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PIK3CBP42338 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PIK3CBP42338 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PIK3CBP42338 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PIK3CBP42338 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PIK3CBP42338 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PIK3CBP42338 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PIK3CBP42338 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PIK3CBP42338 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PIK3CBP42338 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PIK3CBP42338 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
PIK3CBP42338 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PIK3CBP42338 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PIK3CBP42338 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms