Protein–RNA interactions for Protein: P28290

SSFA2, Sperm-specific antigen 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSFA2P28290 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SSFA2P28290 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SSFA2P28290 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SSFA2P28290 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SSFA2P28290 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
SSFA2P28290 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SSFA2P28290 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC21.29■■□□□ 1
SSFA2P28290 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SSFA2P28290 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SSFA2P28290 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SSFA2P28290 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
SSFA2P28290 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SSFA2P28290 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SSFA2P28290 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SSFA2P28290 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SSFA2P28290 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
SSFA2P28290 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SSFA2P28290 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SSFA2P28290 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
SSFA2P28290 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SSFA2P28290 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SSFA2P28290 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SSFA2P28290 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
SSFA2P28290 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
SSFA2P28290 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SSFA2P28290 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SSFA2P28290 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC21.28■■□□□ 1
SSFA2P28290 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
SSFA2P28290 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC21.28■■□□□ 1
SSFA2P28290 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SSFA2P28290 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SSFA2P28290 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SSFA2P28290 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SSFA2P28290 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SSFA2P28290 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SSFA2P28290 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SSFA2P28290 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SSFA2P28290 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SSFA2P28290 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SSFA2P28290 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SSFA2P28290 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SSFA2P28290 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SSFA2P28290 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SSFA2P28290 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SSFA2P28290 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SSFA2P28290 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SSFA2P28290 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SSFA2P28290 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SSFA2P28290 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SSFA2P28290 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC21.27■■□□□ 1
SSFA2P28290 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
SSFA2P28290 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
SSFA2P28290 EMC4-203ENST00000557879 1009 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
SSFA2P28290 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
SSFA2P28290 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SSFA2P28290 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SSFA2P28290 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC21.27■■□□□ 1
SSFA2P28290 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC21.27■■□□□ 1
SSFA2P28290 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SSFA2P28290 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC21.27■■□□□ 1
SSFA2P28290 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SSFA2P28290 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SSFA2P28290 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SSFA2P28290 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SSFA2P28290 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SSFA2P28290 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SSFA2P28290 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SSFA2P28290 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
SSFA2P28290 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
SSFA2P28290 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
SSFA2P28290 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
SSFA2P28290 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SSFA2P28290 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SSFA2P28290 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SSFA2P28290 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SSFA2P28290 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SSFA2P28290 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SSFA2P28290 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SSFA2P28290 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SSFA2P28290 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SSFA2P28290 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SSFA2P28290 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SSFA2P28290 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SSFA2P28290 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SSFA2P28290 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SSFA2P28290 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SSFA2P28290 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SSFA2P28290 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SSFA2P28290 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SSFA2P28290 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
SSFA2P28290 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SSFA2P28290 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SSFA2P28290 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SSFA2P28290 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
SSFA2P28290 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
SSFA2P28290 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
SSFA2P28290 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
SSFA2P28290 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SSFA2P28290 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
SSFA2P28290 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66 ms