Protein–RNA interactions for Protein: P28288

ABCD3, ATP-binding cassette sub-family D member 3, humanhuman

Predictions only

Length 659 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCD3P28288 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ABCD3P28288 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ABCD3P28288 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ABCD3P28288 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ABCD3P28288 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ABCD3P28288 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ABCD3P28288 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ABCD3P28288 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ABCD3P28288 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ABCD3P28288 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ABCD3P28288 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
ABCD3P28288 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ABCD3P28288 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
ABCD3P28288 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
ABCD3P28288 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ABCD3P28288 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ABCD3P28288 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ABCD3P28288 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ABCD3P28288 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ABCD3P28288 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ABCD3P28288 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ABCD3P28288 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ABCD3P28288 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ABCD3P28288 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ABCD3P28288 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ABCD3P28288 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ABCD3P28288 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ABCD3P28288 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ABCD3P28288 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ABCD3P28288 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ABCD3P28288 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ABCD3P28288 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ABCD3P28288 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
ABCD3P28288 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ABCD3P28288 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
ABCD3P28288 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ABCD3P28288 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ABCD3P28288 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ABCD3P28288 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ABCD3P28288 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ABCD3P28288 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ABCD3P28288 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ABCD3P28288 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ABCD3P28288 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ABCD3P28288 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ABCD3P28288 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ABCD3P28288 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ABCD3P28288 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ABCD3P28288 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ABCD3P28288 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ABCD3P28288 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ABCD3P28288 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ABCD3P28288 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ABCD3P28288 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ABCD3P28288 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ABCD3P28288 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ABCD3P28288 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
ABCD3P28288 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ABCD3P28288 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ABCD3P28288 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ABCD3P28288 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ABCD3P28288 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ABCD3P28288 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ABCD3P28288 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
ABCD3P28288 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ABCD3P28288 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ABCD3P28288 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ABCD3P28288 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ABCD3P28288 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ABCD3P28288 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ABCD3P28288 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ABCD3P28288 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ABCD3P28288 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ABCD3P28288 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ABCD3P28288 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ABCD3P28288 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ABCD3P28288 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ABCD3P28288 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ABCD3P28288 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ABCD3P28288 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ABCD3P28288 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ABCD3P28288 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ABCD3P28288 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ABCD3P28288 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ABCD3P28288 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ABCD3P28288 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ABCD3P28288 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ABCD3P28288 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ABCD3P28288 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ABCD3P28288 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ABCD3P28288 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ABCD3P28288 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ABCD3P28288 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ABCD3P28288 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
ABCD3P28288 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ABCD3P28288 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ABCD3P28288 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
ABCD3P28288 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ABCD3P28288 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ABCD3P28288 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms