Protein–RNA interactions for Protein: P25391

LAMA1, Laminin subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 3,075 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA1P25391 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.15
LAMA1P25391 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
LAMA1P25391 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
LAMA1P25391 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
LAMA1P25391 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
LAMA1P25391 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LAMA1P25391 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LAMA1P25391 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LAMA1P25391 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
LAMA1P25391 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
LAMA1P25391 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LAMA1P25391 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LAMA1P25391 AC008115.1-201ENST00000542291 150 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LAMA1P25391 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LAMA1P25391 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LAMA1P25391 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LAMA1P25391 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LAMA1P25391 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LAMA1P25391 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LAMA1P25391 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LAMA1P25391 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LAMA1P25391 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LAMA1P25391 EMC4-201ENST00000249209 852 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LAMA1P25391 AP002748.3-205ENST00000525142 567 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LAMA1P25391 AP002748.3-203ENST00000533502 581 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LAMA1P25391 ANKS3-227ENST00000592711 580 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LAMA1P25391 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LAMA1P25391 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LAMA1P25391 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LAMA1P25391 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LAMA1P25391 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LAMA1P25391 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LAMA1P25391 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LAMA1P25391 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LAMA1P25391 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
LAMA1P25391 PARP8-218ENST00000513738 596 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
LAMA1P25391 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC16■□□□□ 0.15
LAMA1P25391 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
LAMA1P25391 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LAMA1P25391 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
LAMA1P25391 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LAMA1P25391 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
LAMA1P25391 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
LAMA1P25391 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
LAMA1P25391 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LAMA1P25391 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC16■□□□□ 0.15
LAMA1P25391 EDN2-201ENST00000372587 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LAMA1P25391 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
LAMA1P25391 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC16■□□□□ 0.15
LAMA1P25391 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
LAMA1P25391 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC16■□□□□ 0.15
LAMA1P25391 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LAMA1P25391 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LAMA1P25391 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LAMA1P25391 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
LAMA1P25391 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LAMA1P25391 GBGT1-202ENST00000372038 847 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
LAMA1P25391 PLA2G5-201ENST00000375108 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LAMA1P25391 TPI1-206ENST00000488464 791 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
LAMA1P25391 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
LAMA1P25391 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
LAMA1P25391 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
LAMA1P25391 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
LAMA1P25391 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LAMA1P25391 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LAMA1P25391 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LAMA1P25391 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
LAMA1P25391 PAQR6-214ENST00000613336 1599 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LAMA1P25391 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LAMA1P25391 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
LAMA1P25391 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LAMA1P25391 NME6-203ENST00000415644 849 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LAMA1P25391 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LAMA1P25391 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LAMA1P25391 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LAMA1P25391 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LAMA1P25391 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LAMA1P25391 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LAMA1P25391 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LAMA1P25391 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LAMA1P25391 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LAMA1P25391 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LAMA1P25391 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LAMA1P25391 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LAMA1P25391 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
LAMA1P25391 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LAMA1P25391 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LAMA1P25391 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LAMA1P25391 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LAMA1P25391 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
LAMA1P25391 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LAMA1P25391 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LAMA1P25391 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LAMA1P25391 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LAMA1P25391 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LAMA1P25391 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LAMA1P25391 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LAMA1P25391 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LAMA1P25391 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LAMA1P25391 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms