Protein–RNA interactions for Protein: P18433

PTPRA, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, humanhuman

Predictions only

Length 802 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRAP18433 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PTPRAP18433 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
PTPRAP18433 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PTPRAP18433 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PTPRAP18433 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PTPRAP18433 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PTPRAP18433 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PTPRAP18433 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
PTPRAP18433 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PTPRAP18433 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PTPRAP18433 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
PTPRAP18433 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PTPRAP18433 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PTPRAP18433 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PTPRAP18433 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PTPRAP18433 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PTPRAP18433 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PTPRAP18433 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PTPRAP18433 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PTPRAP18433 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PTPRAP18433 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PTPRAP18433 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
PTPRAP18433 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PTPRAP18433 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
PTPRAP18433 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
PTPRAP18433 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PTPRAP18433 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PTPRAP18433 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PTPRAP18433 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PTPRAP18433 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PTPRAP18433 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PTPRAP18433 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PTPRAP18433 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PTPRAP18433 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PTPRAP18433 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PTPRAP18433 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PTPRAP18433 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PTPRAP18433 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PTPRAP18433 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PTPRAP18433 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PTPRAP18433 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PTPRAP18433 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PTPRAP18433 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
PTPRAP18433 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
PTPRAP18433 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PTPRAP18433 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PTPRAP18433 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
PTPRAP18433 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
PTPRAP18433 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
PTPRAP18433 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PTPRAP18433 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PTPRAP18433 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PTPRAP18433 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PTPRAP18433 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PTPRAP18433 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PTPRAP18433 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
PTPRAP18433 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PTPRAP18433 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PTPRAP18433 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PTPRAP18433 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
PTPRAP18433 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
PTPRAP18433 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
PTPRAP18433 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PTPRAP18433 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PTPRAP18433 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PTPRAP18433 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PTPRAP18433 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PTPRAP18433 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PTPRAP18433 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PTPRAP18433 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PTPRAP18433 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PTPRAP18433 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PTPRAP18433 AL031283.3-201ENST00000439788 727 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PTPRAP18433 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PTPRAP18433 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
PTPRAP18433 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PTPRAP18433 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PTPRAP18433 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PTPRAP18433 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PTPRAP18433 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PTPRAP18433 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PTPRAP18433 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PTPRAP18433 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
PTPRAP18433 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PTPRAP18433 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PTPRAP18433 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PTPRAP18433 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PTPRAP18433 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PTPRAP18433 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PTPRAP18433 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PTPRAP18433 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PTPRAP18433 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PTPRAP18433 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PTPRAP18433 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
PTPRAP18433 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
PTPRAP18433 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PTPRAP18433 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PTPRAP18433 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
PTPRAP18433 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
PTPRAP18433 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.5 ms