Protein–RNA interactions for Protein: P13727

PRG2, Bone marrow proteoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRG2P13727 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRG2P13727 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PRG2P13727 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRG2P13727 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRG2P13727 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRG2P13727 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRG2P13727 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PRG2P13727 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRG2P13727 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PRG2P13727 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRG2P13727 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRG2P13727 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRG2P13727 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRG2P13727 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRG2P13727 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRG2P13727 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRG2P13727 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRG2P13727 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRG2P13727 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRG2P13727 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRG2P13727 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRG2P13727 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRG2P13727 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRG2P13727 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRG2P13727 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRG2P13727 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRG2P13727 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRG2P13727 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRG2P13727 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRG2P13727 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRG2P13727 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRG2P13727 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRG2P13727 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRG2P13727 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRG2P13727 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRG2P13727 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRG2P13727 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRG2P13727 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PRG2P13727 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PRG2P13727 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRG2P13727 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRG2P13727 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRG2P13727 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PRG2P13727 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRG2P13727 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PRG2P13727 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRG2P13727 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRG2P13727 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRG2P13727 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRG2P13727 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PRG2P13727 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRG2P13727 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PRG2P13727 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PRG2P13727 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRG2P13727 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRG2P13727 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PRG2P13727 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRG2P13727 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRG2P13727 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRG2P13727 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRG2P13727 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRG2P13727 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRG2P13727 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRG2P13727 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PRG2P13727 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRG2P13727 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRG2P13727 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRG2P13727 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRG2P13727 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRG2P13727 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRG2P13727 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRG2P13727 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRG2P13727 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRG2P13727 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PRG2P13727 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRG2P13727 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRG2P13727 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRG2P13727 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRG2P13727 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRG2P13727 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRG2P13727 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRG2P13727 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRG2P13727 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRG2P13727 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRG2P13727 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRG2P13727 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRG2P13727 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRG2P13727 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRG2P13727 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRG2P13727 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRG2P13727 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PRG2P13727 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRG2P13727 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRG2P13727 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PRG2P13727 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRG2P13727 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRG2P13727 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRG2P13727 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PRG2P13727 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRG2P13727 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms