Protein–RNA interactions for Protein: P12270

TPR, Nucleoprotein TPR, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPRP12270 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TPRP12270 SSTR5-AS1-201ENST00000565992 575 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TPRP12270 LINC00479-204ENST00000589300 718 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TPRP12270 NEAT1-203ENST00000601801 487 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TPRP12270 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TPRP12270 MIR6756-201ENST00000616240 63 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TPRP12270 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TPRP12270 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TPRP12270 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TPRP12270 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TPRP12270 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TPRP12270 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TPRP12270 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TPRP12270 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TPRP12270 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TPRP12270 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TPRP12270 SERF2-206ENST00000409291 807 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TPRP12270 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TPRP12270 AC093151.3-202ENST00000445073 709 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TPRP12270 FTLP10-202ENST00000505798 471 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TPRP12270 AP002992.1-201ENST00000527519 491 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TPRP12270 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TPRP12270 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TPRP12270 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TPRP12270 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TPRP12270 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TPRP12270 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TPRP12270 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TPRP12270 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TPRP12270 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TPRP12270 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TPRP12270 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TPRP12270 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TPRP12270 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TPRP12270 LSM10-201ENST00000315732 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TPRP12270 AC069218.1-201ENST00000435269 762 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TPRP12270 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TPRP12270 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TPRP12270 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TPRP12270 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TPRP12270 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TPRP12270 AWAT1-201ENST00000374521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TPRP12270 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TPRP12270 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TPRP12270 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TPRP12270 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TPRP12270 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TPRP12270 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TPRP12270 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TPRP12270 IGLC7-201ENST00000390331 441 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TPRP12270 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TPRP12270 PENK-202ENST00000451791 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TPRP12270 ATP6V0CP2-201ENST00000469409 207 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TPRP12270 AC126768.2-201ENST00000511693 718 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TPRP12270 TMBIM4-205ENST00000535812 766 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TPRP12270 TMBIM4-212ENST00000556010 610 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TPRP12270 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TPRP12270 AL592295.3-201ENST00000637155 863 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TPRP12270 COLEC11-201ENST00000236693 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TPRP12270 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TPRP12270 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TPRP12270 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TPRP12270 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TPRP12270 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TPRP12270 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TPRP12270 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TPRP12270 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TPRP12270 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TPRP12270 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TPRP12270 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TPRP12270 CTNNBIP1-202ENST00000377258 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TPRP12270 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TPRP12270 AC004471.1-201ENST00000456035 582 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TPRP12270 MPZL3-203ENST00000525386 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TPRP12270 AL353726.2-201ENST00000623259 884 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TPRP12270 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TPRP12270 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TPRP12270 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TPRP12270 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TPRP12270 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TPRP12270 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TPRP12270 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TPRP12270 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TPRP12270 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TPRP12270 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TPRP12270 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TPRP12270 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TPRP12270 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TPRP12270 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TPRP12270 Z93015.1-201ENST00000451718 390 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
TPRP12270 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TPRP12270 AC006487.1-201ENST00000514506 1221 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TPRP12270 FBXL12-212ENST00000592067 879 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TPRP12270 AC008687.7-202ENST00000637404 953 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
TPRP12270 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TPRP12270 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TPRP12270 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TPRP12270 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TPRP12270 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TPRP12270 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.6 ms