Protein–RNA interactions for Protein: P0DMQ9

C8orf89, Putative uncharacterized protein C8orf89, humanhuman

Predictions only

Length 161 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C8orf89P0DMQ9 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
C8orf89P0DMQ9 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
C8orf89P0DMQ9 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
C8orf89P0DMQ9 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
C8orf89P0DMQ9 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
C8orf89P0DMQ9 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
C8orf89P0DMQ9 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
C8orf89P0DMQ9 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
C8orf89P0DMQ9 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
C8orf89P0DMQ9 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
C8orf89P0DMQ9 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
C8orf89P0DMQ9 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
C8orf89P0DMQ9 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
C8orf89P0DMQ9 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
C8orf89P0DMQ9 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
C8orf89P0DMQ9 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
C8orf89P0DMQ9 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
C8orf89P0DMQ9 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
C8orf89P0DMQ9 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
C8orf89P0DMQ9 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
C8orf89P0DMQ9 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
C8orf89P0DMQ9 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
C8orf89P0DMQ9 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
C8orf89P0DMQ9 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
C8orf89P0DMQ9 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
C8orf89P0DMQ9 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
C8orf89P0DMQ9 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
C8orf89P0DMQ9 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
C8orf89P0DMQ9 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
C8orf89P0DMQ9 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
C8orf89P0DMQ9 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
C8orf89P0DMQ9 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
C8orf89P0DMQ9 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
C8orf89P0DMQ9 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
C8orf89P0DMQ9 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
C8orf89P0DMQ9 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
C8orf89P0DMQ9 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
C8orf89P0DMQ9 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
C8orf89P0DMQ9 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
C8orf89P0DMQ9 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
C8orf89P0DMQ9 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
C8orf89P0DMQ9 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
C8orf89P0DMQ9 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
C8orf89P0DMQ9 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
C8orf89P0DMQ9 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
C8orf89P0DMQ9 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
C8orf89P0DMQ9 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
C8orf89P0DMQ9 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
C8orf89P0DMQ9 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
C8orf89P0DMQ9 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
C8orf89P0DMQ9 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
C8orf89P0DMQ9 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
C8orf89P0DMQ9 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
C8orf89P0DMQ9 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
C8orf89P0DMQ9 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
C8orf89P0DMQ9 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
C8orf89P0DMQ9 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
C8orf89P0DMQ9 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
C8orf89P0DMQ9 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
C8orf89P0DMQ9 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
C8orf89P0DMQ9 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
C8orf89P0DMQ9 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
C8orf89P0DMQ9 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
C8orf89P0DMQ9 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
C8orf89P0DMQ9 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
C8orf89P0DMQ9 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
C8orf89P0DMQ9 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
C8orf89P0DMQ9 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
C8orf89P0DMQ9 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
C8orf89P0DMQ9 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
C8orf89P0DMQ9 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
C8orf89P0DMQ9 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
C8orf89P0DMQ9 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
C8orf89P0DMQ9 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
C8orf89P0DMQ9 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
C8orf89P0DMQ9 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
C8orf89P0DMQ9 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
C8orf89P0DMQ9 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
C8orf89P0DMQ9 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
C8orf89P0DMQ9 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
C8orf89P0DMQ9 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
C8orf89P0DMQ9 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
C8orf89P0DMQ9 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
C8orf89P0DMQ9 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
C8orf89P0DMQ9 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
C8orf89P0DMQ9 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
C8orf89P0DMQ9 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
C8orf89P0DMQ9 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
C8orf89P0DMQ9 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
C8orf89P0DMQ9 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
C8orf89P0DMQ9 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
C8orf89P0DMQ9 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
C8orf89P0DMQ9 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
C8orf89P0DMQ9 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
C8orf89P0DMQ9 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
C8orf89P0DMQ9 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
C8orf89P0DMQ9 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
C8orf89P0DMQ9 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
C8orf89P0DMQ9 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
C8orf89P0DMQ9 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms