Protein–RNA interactions for Protein: O95819

MAP4K4, Mitogen-activated protein kinase kinase kinase kinase 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,239 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP4K4O95819 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
MAP4K4O95819 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
MAP4K4O95819 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
MAP4K4O95819 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
MAP4K4O95819 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
MAP4K4O95819 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
MAP4K4O95819 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
MAP4K4O95819 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
MAP4K4O95819 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
MAP4K4O95819 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
MAP4K4O95819 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
MAP4K4O95819 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
MAP4K4O95819 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
MAP4K4O95819 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
MAP4K4O95819 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
MAP4K4O95819 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
MAP4K4O95819 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
MAP4K4O95819 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
MAP4K4O95819 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
MAP4K4O95819 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
MAP4K4O95819 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
MAP4K4O95819 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
MAP4K4O95819 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
MAP4K4O95819 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
MAP4K4O95819 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
MAP4K4O95819 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
MAP4K4O95819 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
MAP4K4O95819 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
MAP4K4O95819 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
MAP4K4O95819 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
MAP4K4O95819 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
MAP4K4O95819 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
MAP4K4O95819 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
MAP4K4O95819 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
MAP4K4O95819 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
MAP4K4O95819 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
MAP4K4O95819 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
MAP4K4O95819 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
MAP4K4O95819 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
MAP4K4O95819 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
MAP4K4O95819 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
MAP4K4O95819 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
MAP4K4O95819 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
MAP4K4O95819 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
MAP4K4O95819 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
MAP4K4O95819 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
MAP4K4O95819 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
MAP4K4O95819 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
MAP4K4O95819 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
MAP4K4O95819 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
MAP4K4O95819 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
MAP4K4O95819 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
MAP4K4O95819 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
MAP4K4O95819 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
MAP4K4O95819 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
MAP4K4O95819 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
MAP4K4O95819 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
MAP4K4O95819 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
MAP4K4O95819 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
MAP4K4O95819 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
MAP4K4O95819 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
MAP4K4O95819 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
MAP4K4O95819 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
MAP4K4O95819 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
MAP4K4O95819 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
MAP4K4O95819 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
MAP4K4O95819 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
MAP4K4O95819 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
MAP4K4O95819 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
MAP4K4O95819 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
MAP4K4O95819 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
MAP4K4O95819 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
MAP4K4O95819 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
MAP4K4O95819 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
MAP4K4O95819 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
MAP4K4O95819 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
MAP4K4O95819 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
MAP4K4O95819 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC20.37■□□□□ 0.85
MAP4K4O95819 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
MAP4K4O95819 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC20.37■□□□□ 0.85
MAP4K4O95819 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
MAP4K4O95819 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
MAP4K4O95819 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
MAP4K4O95819 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
MAP4K4O95819 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
MAP4K4O95819 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
MAP4K4O95819 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
MAP4K4O95819 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
MAP4K4O95819 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
MAP4K4O95819 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
MAP4K4O95819 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
MAP4K4O95819 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
MAP4K4O95819 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
MAP4K4O95819 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
MAP4K4O95819 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
MAP4K4O95819 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
MAP4K4O95819 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
MAP4K4O95819 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
MAP4K4O95819 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
MAP4K4O95819 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.1 ms