Protein–RNA interactions for Protein: O60931

CTNS, Cystinosin, humanhuman

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNSO60931 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTNSO60931 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTNSO60931 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CTNSO60931 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTNSO60931 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTNSO60931 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTNSO60931 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTNSO60931 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTNSO60931 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTNSO60931 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTNSO60931 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTNSO60931 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTNSO60931 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTNSO60931 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTNSO60931 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTNSO60931 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTNSO60931 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTNSO60931 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTNSO60931 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTNSO60931 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTNSO60931 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTNSO60931 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTNSO60931 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTNSO60931 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTNSO60931 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTNSO60931 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTNSO60931 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTNSO60931 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTNSO60931 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTNSO60931 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTNSO60931 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTNSO60931 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTNSO60931 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTNSO60931 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTNSO60931 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTNSO60931 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTNSO60931 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTNSO60931 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTNSO60931 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTNSO60931 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTNSO60931 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTNSO60931 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CTNSO60931 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTNSO60931 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTNSO60931 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTNSO60931 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTNSO60931 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTNSO60931 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CTNSO60931 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTNSO60931 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTNSO60931 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTNSO60931 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTNSO60931 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTNSO60931 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTNSO60931 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTNSO60931 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTNSO60931 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTNSO60931 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTNSO60931 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTNSO60931 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTNSO60931 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTNSO60931 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTNSO60931 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTNSO60931 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTNSO60931 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTNSO60931 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTNSO60931 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CTNSO60931 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTNSO60931 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CTNSO60931 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTNSO60931 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTNSO60931 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTNSO60931 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTNSO60931 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTNSO60931 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTNSO60931 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTNSO60931 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CTNSO60931 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTNSO60931 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CTNSO60931 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTNSO60931 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTNSO60931 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTNSO60931 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTNSO60931 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTNSO60931 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTNSO60931 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTNSO60931 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTNSO60931 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTNSO60931 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTNSO60931 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTNSO60931 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTNSO60931 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTNSO60931 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTNSO60931 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTNSO60931 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTNSO60931 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTNSO60931 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTNSO60931 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTNSO60931 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTNSO60931 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.7 ms