Protein–RNA interactions for Protein: O43861

ATP9B, Probable phospholipid-transporting ATPase IIB, humanhuman

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Length 1,147 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP9BO43861 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ATP9BO43861 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ATP9BO43861 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ATP9BO43861 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ATP9BO43861 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ATP9BO43861 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ATP9BO43861 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ATP9BO43861 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ATP9BO43861 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ATP9BO43861 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ATP9BO43861 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ATP9BO43861 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ATP9BO43861 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ATP9BO43861 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ATP9BO43861 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ATP9BO43861 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ATP9BO43861 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ATP9BO43861 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ATP9BO43861 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ATP9BO43861 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ATP9BO43861 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ATP9BO43861 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ATP9BO43861 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ATP9BO43861 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ATP9BO43861 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ATP9BO43861 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ATP9BO43861 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
ATP9BO43861 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ATP9BO43861 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ATP9BO43861 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ATP9BO43861 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ATP9BO43861 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ATP9BO43861 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ATP9BO43861 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ATP9BO43861 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ATP9BO43861 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ATP9BO43861 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ATP9BO43861 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ATP9BO43861 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ATP9BO43861 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ATP9BO43861 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ATP9BO43861 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ATP9BO43861 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ATP9BO43861 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ATP9BO43861 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ATP9BO43861 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ATP9BO43861 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ATP9BO43861 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ATP9BO43861 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ATP9BO43861 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ATP9BO43861 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ATP9BO43861 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ATP9BO43861 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ATP9BO43861 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ATP9BO43861 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ATP9BO43861 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ATP9BO43861 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ATP9BO43861 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ATP9BO43861 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ATP9BO43861 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ATP9BO43861 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ATP9BO43861 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ATP9BO43861 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ATP9BO43861 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ATP9BO43861 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ATP9BO43861 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ATP9BO43861 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ATP9BO43861 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ATP9BO43861 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ATP9BO43861 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ATP9BO43861 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ATP9BO43861 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ATP9BO43861 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
ATP9BO43861 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ATP9BO43861 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
ATP9BO43861 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ATP9BO43861 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ATP9BO43861 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ATP9BO43861 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ATP9BO43861 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ATP9BO43861 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ATP9BO43861 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ATP9BO43861 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
ATP9BO43861 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ATP9BO43861 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ATP9BO43861 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ATP9BO43861 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ATP9BO43861 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ATP9BO43861 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ATP9BO43861 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ATP9BO43861 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ATP9BO43861 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ATP9BO43861 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ATP9BO43861 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ATP9BO43861 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ATP9BO43861 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ATP9BO43861 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ATP9BO43861 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ATP9BO43861 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ATP9BO43861 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
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