Protein–RNA interactions for Protein: O43854

EDIL3, EGF-like repeat and discoidin I-like domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDIL3O43854 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
EDIL3O43854 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
EDIL3O43854 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
EDIL3O43854 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC18.57■□□□□ 0.56
EDIL3O43854 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
EDIL3O43854 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
EDIL3O43854 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
EDIL3O43854 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
EDIL3O43854 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
EDIL3O43854 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
EDIL3O43854 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
EDIL3O43854 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
EDIL3O43854 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
EDIL3O43854 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
EDIL3O43854 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
EDIL3O43854 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
EDIL3O43854 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
EDIL3O43854 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
EDIL3O43854 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
EDIL3O43854 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
EDIL3O43854 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
EDIL3O43854 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
EDIL3O43854 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
EDIL3O43854 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
EDIL3O43854 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
EDIL3O43854 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
EDIL3O43854 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
EDIL3O43854 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
EDIL3O43854 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
EDIL3O43854 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
EDIL3O43854 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
EDIL3O43854 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
EDIL3O43854 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
EDIL3O43854 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
EDIL3O43854 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
EDIL3O43854 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
EDIL3O43854 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
EDIL3O43854 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
EDIL3O43854 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
EDIL3O43854 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
EDIL3O43854 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
EDIL3O43854 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
EDIL3O43854 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
EDIL3O43854 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
EDIL3O43854 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
EDIL3O43854 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
EDIL3O43854 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
EDIL3O43854 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
EDIL3O43854 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
EDIL3O43854 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
EDIL3O43854 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
EDIL3O43854 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
EDIL3O43854 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
EDIL3O43854 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
EDIL3O43854 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
EDIL3O43854 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
EDIL3O43854 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
EDIL3O43854 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
EDIL3O43854 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
EDIL3O43854 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
EDIL3O43854 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
EDIL3O43854 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
EDIL3O43854 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
EDIL3O43854 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
EDIL3O43854 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
EDIL3O43854 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
EDIL3O43854 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
EDIL3O43854 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
EDIL3O43854 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
EDIL3O43854 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
EDIL3O43854 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
EDIL3O43854 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
EDIL3O43854 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
EDIL3O43854 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
EDIL3O43854 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
EDIL3O43854 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
EDIL3O43854 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
EDIL3O43854 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
EDIL3O43854 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
EDIL3O43854 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
EDIL3O43854 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
EDIL3O43854 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
EDIL3O43854 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
EDIL3O43854 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
EDIL3O43854 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
EDIL3O43854 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
EDIL3O43854 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
EDIL3O43854 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
EDIL3O43854 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
EDIL3O43854 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
EDIL3O43854 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
EDIL3O43854 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
EDIL3O43854 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
EDIL3O43854 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
EDIL3O43854 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
EDIL3O43854 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
EDIL3O43854 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
EDIL3O43854 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
EDIL3O43854 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
EDIL3O43854 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.6 ms