Protein–RNA interactions for Protein: O43312

MTSS1, Metastasis suppressor protein 1, humanhuman

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Length 755 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTSS1O43312 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
MTSS1O43312 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
MTSS1O43312 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MTSS1O43312 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
MTSS1O43312 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MTSS1O43312 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MTSS1O43312 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
MTSS1O43312 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MTSS1O43312 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
MTSS1O43312 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MTSS1O43312 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
MTSS1O43312 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
MTSS1O43312 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
MTSS1O43312 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MTSS1O43312 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
MTSS1O43312 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MTSS1O43312 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MTSS1O43312 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MTSS1O43312 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
MTSS1O43312 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
MTSS1O43312 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
MTSS1O43312 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MTSS1O43312 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MTSS1O43312 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MTSS1O43312 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MTSS1O43312 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
MTSS1O43312 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
MTSS1O43312 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
MTSS1O43312 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
MTSS1O43312 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
MTSS1O43312 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MTSS1O43312 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
MTSS1O43312 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
MTSS1O43312 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
MTSS1O43312 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
MTSS1O43312 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
MTSS1O43312 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
MTSS1O43312 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
MTSS1O43312 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
MTSS1O43312 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MTSS1O43312 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
MTSS1O43312 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
MTSS1O43312 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
MTSS1O43312 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
MTSS1O43312 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MTSS1O43312 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MTSS1O43312 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
MTSS1O43312 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MTSS1O43312 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MTSS1O43312 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
MTSS1O43312 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
MTSS1O43312 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
MTSS1O43312 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MTSS1O43312 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MTSS1O43312 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MTSS1O43312 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
MTSS1O43312 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MTSS1O43312 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MTSS1O43312 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
MTSS1O43312 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MTSS1O43312 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MTSS1O43312 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MTSS1O43312 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MTSS1O43312 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
MTSS1O43312 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
MTSS1O43312 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
MTSS1O43312 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
MTSS1O43312 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
MTSS1O43312 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
MTSS1O43312 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
MTSS1O43312 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MTSS1O43312 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
MTSS1O43312 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MTSS1O43312 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
MTSS1O43312 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
MTSS1O43312 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
MTSS1O43312 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MTSS1O43312 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
MTSS1O43312 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MTSS1O43312 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MTSS1O43312 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
MTSS1O43312 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MTSS1O43312 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
MTSS1O43312 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MTSS1O43312 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
MTSS1O43312 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
MTSS1O43312 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
MTSS1O43312 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MTSS1O43312 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MTSS1O43312 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
MTSS1O43312 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
MTSS1O43312 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
MTSS1O43312 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
MTSS1O43312 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
MTSS1O43312 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
MTSS1O43312 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
MTSS1O43312 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
MTSS1O43312 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
MTSS1O43312 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
MTSS1O43312 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
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