Protein–RNA interactions for Protein: E9PBE3

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 544 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E9PBE3 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
E9PBE3 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
E9PBE3 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
E9PBE3 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
E9PBE3 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
E9PBE3 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
E9PBE3 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
E9PBE3 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
E9PBE3 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
E9PBE3 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
E9PBE3 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
E9PBE3 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
E9PBE3 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
E9PBE3 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
E9PBE3 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC16.31■□□□□ 0.2
E9PBE3 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
E9PBE3 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
E9PBE3 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
E9PBE3 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
E9PBE3 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
E9PBE3 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
E9PBE3 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
E9PBE3 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
E9PBE3 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
E9PBE3 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
E9PBE3 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
E9PBE3 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
E9PBE3 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
E9PBE3 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
E9PBE3 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
E9PBE3 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
E9PBE3 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
E9PBE3 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
E9PBE3 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
E9PBE3 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
E9PBE3 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
E9PBE3 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
E9PBE3 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
E9PBE3 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
E9PBE3 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
E9PBE3 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
E9PBE3 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
E9PBE3 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
E9PBE3 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
E9PBE3 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
E9PBE3 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
E9PBE3 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
E9PBE3 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
E9PBE3 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
E9PBE3 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
E9PBE3 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
E9PBE3 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
E9PBE3 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
E9PBE3 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
E9PBE3 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC16.3■□□□□ 0.2
E9PBE3 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
E9PBE3 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
E9PBE3 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
E9PBE3 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
E9PBE3 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
E9PBE3 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
E9PBE3 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
E9PBE3 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
E9PBE3 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
E9PBE3 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
E9PBE3 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
E9PBE3 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
E9PBE3 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
E9PBE3 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
E9PBE3 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
E9PBE3 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
E9PBE3 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
E9PBE3 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
E9PBE3 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
E9PBE3 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
E9PBE3 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
E9PBE3 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
E9PBE3 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
E9PBE3 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
E9PBE3 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
E9PBE3 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
E9PBE3 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
E9PBE3 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
E9PBE3 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
E9PBE3 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
E9PBE3 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
E9PBE3 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
E9PBE3 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
E9PBE3 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC16.29■□□□□ 0.2
E9PBE3 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
E9PBE3 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
E9PBE3 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC16.29■□□□□ 0.2
E9PBE3 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC16.29■□□□□ 0.2
E9PBE3 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
E9PBE3 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
E9PBE3 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
E9PBE3 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
E9PBE3 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
E9PBE3 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
E9PBE3 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms