Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH8

ERVV-1, Endogenous retrovirus group V member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-1B6SEH8 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ERVV-1B6SEH8 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ERVV-1B6SEH8 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ERVV-1B6SEH8 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ERVV-1B6SEH8 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ERVV-1B6SEH8 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ERVV-1B6SEH8 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ERVV-1B6SEH8 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ERVV-1B6SEH8 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ERVV-1B6SEH8 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ERVV-1B6SEH8 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ERVV-1B6SEH8 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ERVV-1B6SEH8 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ERVV-1B6SEH8 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ERVV-1B6SEH8 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ERVV-1B6SEH8 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ERVV-1B6SEH8 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ERVV-1B6SEH8 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ERVV-1B6SEH8 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ERVV-1B6SEH8 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ERVV-1B6SEH8 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
ERVV-1B6SEH8 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ERVV-1B6SEH8 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ERVV-1B6SEH8 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ERVV-1B6SEH8 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
ERVV-1B6SEH8 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ERVV-1B6SEH8 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
ERVV-1B6SEH8 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
ERVV-1B6SEH8 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
ERVV-1B6SEH8 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
ERVV-1B6SEH8 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ERVV-1B6SEH8 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ERVV-1B6SEH8 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
ERVV-1B6SEH8 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ERVV-1B6SEH8 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ERVV-1B6SEH8 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ERVV-1B6SEH8 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ERVV-1B6SEH8 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ERVV-1B6SEH8 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ERVV-1B6SEH8 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ERVV-1B6SEH8 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ERVV-1B6SEH8 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ERVV-1B6SEH8 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ERVV-1B6SEH8 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ERVV-1B6SEH8 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ERVV-1B6SEH8 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ERVV-1B6SEH8 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ERVV-1B6SEH8 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ERVV-1B6SEH8 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ERVV-1B6SEH8 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ERVV-1B6SEH8 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
ERVV-1B6SEH8 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ERVV-1B6SEH8 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ERVV-1B6SEH8 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ERVV-1B6SEH8 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ERVV-1B6SEH8 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ERVV-1B6SEH8 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
ERVV-1B6SEH8 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ERVV-1B6SEH8 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ERVV-1B6SEH8 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ERVV-1B6SEH8 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
ERVV-1B6SEH8 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ERVV-1B6SEH8 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ERVV-1B6SEH8 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ERVV-1B6SEH8 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ERVV-1B6SEH8 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
ERVV-1B6SEH8 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ERVV-1B6SEH8 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ERVV-1B6SEH8 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ERVV-1B6SEH8 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
ERVV-1B6SEH8 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ERVV-1B6SEH8 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ERVV-1B6SEH8 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ERVV-1B6SEH8 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ERVV-1B6SEH8 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ERVV-1B6SEH8 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ERVV-1B6SEH8 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ERVV-1B6SEH8 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
ERVV-1B6SEH8 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ERVV-1B6SEH8 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
ERVV-1B6SEH8 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ERVV-1B6SEH8 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ERVV-1B6SEH8 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ERVV-1B6SEH8 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ERVV-1B6SEH8 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
ERVV-1B6SEH8 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ERVV-1B6SEH8 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ERVV-1B6SEH8 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ERVV-1B6SEH8 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
ERVV-1B6SEH8 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ERVV-1B6SEH8 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ERVV-1B6SEH8 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ERVV-1B6SEH8 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ERVV-1B6SEH8 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ERVV-1B6SEH8 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ERVV-1B6SEH8 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ERVV-1B6SEH8 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ERVV-1B6SEH8 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ERVV-1B6SEH8 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ERVV-1B6SEH8 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.8 ms