Protein–RNA interactions for Protein: A6NDB9

PALM3, Paralemmin-3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 673 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PALM3A6NDB9 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PALM3A6NDB9 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PALM3A6NDB9 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PALM3A6NDB9 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
PALM3A6NDB9 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PALM3A6NDB9 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PALM3A6NDB9 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PALM3A6NDB9 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PALM3A6NDB9 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PALM3A6NDB9 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PALM3A6NDB9 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PALM3A6NDB9 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PALM3A6NDB9 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PALM3A6NDB9 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PALM3A6NDB9 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PALM3A6NDB9 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PALM3A6NDB9 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PALM3A6NDB9 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
PALM3A6NDB9 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PALM3A6NDB9 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PALM3A6NDB9 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PALM3A6NDB9 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PALM3A6NDB9 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PALM3A6NDB9 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PALM3A6NDB9 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PALM3A6NDB9 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PALM3A6NDB9 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PALM3A6NDB9 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PALM3A6NDB9 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PALM3A6NDB9 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PALM3A6NDB9 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
PALM3A6NDB9 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PALM3A6NDB9 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PALM3A6NDB9 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PALM3A6NDB9 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PALM3A6NDB9 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PALM3A6NDB9 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PALM3A6NDB9 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PALM3A6NDB9 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PALM3A6NDB9 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PALM3A6NDB9 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PALM3A6NDB9 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PALM3A6NDB9 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PALM3A6NDB9 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PALM3A6NDB9 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PALM3A6NDB9 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PALM3A6NDB9 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PALM3A6NDB9 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PALM3A6NDB9 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PALM3A6NDB9 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PALM3A6NDB9 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PALM3A6NDB9 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PALM3A6NDB9 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PALM3A6NDB9 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PALM3A6NDB9 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PALM3A6NDB9 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PALM3A6NDB9 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PALM3A6NDB9 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PALM3A6NDB9 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PALM3A6NDB9 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PALM3A6NDB9 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PALM3A6NDB9 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PALM3A6NDB9 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PALM3A6NDB9 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
PALM3A6NDB9 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PALM3A6NDB9 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PALM3A6NDB9 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PALM3A6NDB9 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PALM3A6NDB9 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PALM3A6NDB9 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PALM3A6NDB9 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PALM3A6NDB9 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PALM3A6NDB9 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PALM3A6NDB9 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PALM3A6NDB9 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PALM3A6NDB9 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PALM3A6NDB9 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PALM3A6NDB9 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PALM3A6NDB9 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PALM3A6NDB9 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PALM3A6NDB9 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PALM3A6NDB9 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PALM3A6NDB9 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PALM3A6NDB9 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
PALM3A6NDB9 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PALM3A6NDB9 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PALM3A6NDB9 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PALM3A6NDB9 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PALM3A6NDB9 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PALM3A6NDB9 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PALM3A6NDB9 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PALM3A6NDB9 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PALM3A6NDB9 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PALM3A6NDB9 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PALM3A6NDB9 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PALM3A6NDB9 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PALM3A6NDB9 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PALM3A6NDB9 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PALM3A6NDB9 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PALM3A6NDB9 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.6 ms