Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y296

TRAPPC4, Trafficking protein particle complex subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC4Q9Y296 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRAPPC4Q9Y296 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRAPPC4Q9Y296 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRAPPC4Q9Y296 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRAPPC4Q9Y296 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRAPPC4Q9Y296 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRAPPC4Q9Y296 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRAPPC4Q9Y296 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRAPPC4Q9Y296 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRAPPC4Q9Y296 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRAPPC4Q9Y296 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRAPPC4Q9Y296 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRAPPC4Q9Y296 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRAPPC4Q9Y296 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
TRAPPC4Q9Y296 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRAPPC4Q9Y296 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRAPPC4Q9Y296 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRAPPC4Q9Y296 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRAPPC4Q9Y296 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRAPPC4Q9Y296 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRAPPC4Q9Y296 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRAPPC4Q9Y296 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRAPPC4Q9Y296 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRAPPC4Q9Y296 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRAPPC4Q9Y296 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRAPPC4Q9Y296 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRAPPC4Q9Y296 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRAPPC4Q9Y296 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRAPPC4Q9Y296 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRAPPC4Q9Y296 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRAPPC4Q9Y296 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRAPPC4Q9Y296 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRAPPC4Q9Y296 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRAPPC4Q9Y296 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRAPPC4Q9Y296 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRAPPC4Q9Y296 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRAPPC4Q9Y296 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRAPPC4Q9Y296 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRAPPC4Q9Y296 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRAPPC4Q9Y296 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRAPPC4Q9Y296 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRAPPC4Q9Y296 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRAPPC4Q9Y296 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRAPPC4Q9Y296 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRAPPC4Q9Y296 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRAPPC4Q9Y296 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
TRAPPC4Q9Y296 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRAPPC4Q9Y296 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRAPPC4Q9Y296 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRAPPC4Q9Y296 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRAPPC4Q9Y296 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRAPPC4Q9Y296 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRAPPC4Q9Y296 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
TRAPPC4Q9Y296 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRAPPC4Q9Y296 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRAPPC4Q9Y296 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRAPPC4Q9Y296 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRAPPC4Q9Y296 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRAPPC4Q9Y296 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
TRAPPC4Q9Y296 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRAPPC4Q9Y296 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
TRAPPC4Q9Y296 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRAPPC4Q9Y296 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRAPPC4Q9Y296 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRAPPC4Q9Y296 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRAPPC4Q9Y296 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRAPPC4Q9Y296 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRAPPC4Q9Y296 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRAPPC4Q9Y296 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRAPPC4Q9Y296 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRAPPC4Q9Y296 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRAPPC4Q9Y296 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRAPPC4Q9Y296 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRAPPC4Q9Y296 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRAPPC4Q9Y296 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRAPPC4Q9Y296 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRAPPC4Q9Y296 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRAPPC4Q9Y296 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRAPPC4Q9Y296 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRAPPC4Q9Y296 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRAPPC4Q9Y296 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRAPPC4Q9Y296 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRAPPC4Q9Y296 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRAPPC4Q9Y296 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRAPPC4Q9Y296 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRAPPC4Q9Y296 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRAPPC4Q9Y296 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRAPPC4Q9Y296 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRAPPC4Q9Y296 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRAPPC4Q9Y296 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRAPPC4Q9Y296 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
TRAPPC4Q9Y296 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
TRAPPC4Q9Y296 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
TRAPPC4Q9Y296 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRAPPC4Q9Y296 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRAPPC4Q9Y296 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRAPPC4Q9Y296 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRAPPC4Q9Y296 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
TRAPPC4Q9Y296 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
TRAPPC4Q9Y296 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.4 ms