Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPQ4

TRIM35, Tripartite motif-containing protein 35, humanhuman

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Length 493 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM35Q9UPQ4 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRIM35Q9UPQ4 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRIM35Q9UPQ4 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRIM35Q9UPQ4 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
TRIM35Q9UPQ4 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRIM35Q9UPQ4 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRIM35Q9UPQ4 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
TRIM35Q9UPQ4 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRIM35Q9UPQ4 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRIM35Q9UPQ4 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
TRIM35Q9UPQ4 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRIM35Q9UPQ4 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRIM35Q9UPQ4 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRIM35Q9UPQ4 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRIM35Q9UPQ4 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRIM35Q9UPQ4 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRIM35Q9UPQ4 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRIM35Q9UPQ4 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRIM35Q9UPQ4 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRIM35Q9UPQ4 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRIM35Q9UPQ4 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRIM35Q9UPQ4 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRIM35Q9UPQ4 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRIM35Q9UPQ4 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRIM35Q9UPQ4 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRIM35Q9UPQ4 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRIM35Q9UPQ4 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
TRIM35Q9UPQ4 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRIM35Q9UPQ4 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRIM35Q9UPQ4 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRIM35Q9UPQ4 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRIM35Q9UPQ4 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRIM35Q9UPQ4 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRIM35Q9UPQ4 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRIM35Q9UPQ4 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRIM35Q9UPQ4 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRIM35Q9UPQ4 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRIM35Q9UPQ4 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
TRIM35Q9UPQ4 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
TRIM35Q9UPQ4 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRIM35Q9UPQ4 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRIM35Q9UPQ4 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRIM35Q9UPQ4 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRIM35Q9UPQ4 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
TRIM35Q9UPQ4 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
TRIM35Q9UPQ4 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRIM35Q9UPQ4 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRIM35Q9UPQ4 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRIM35Q9UPQ4 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRIM35Q9UPQ4 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRIM35Q9UPQ4 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRIM35Q9UPQ4 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRIM35Q9UPQ4 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRIM35Q9UPQ4 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRIM35Q9UPQ4 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRIM35Q9UPQ4 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRIM35Q9UPQ4 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRIM35Q9UPQ4 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRIM35Q9UPQ4 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRIM35Q9UPQ4 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRIM35Q9UPQ4 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRIM35Q9UPQ4 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRIM35Q9UPQ4 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRIM35Q9UPQ4 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRIM35Q9UPQ4 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRIM35Q9UPQ4 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRIM35Q9UPQ4 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRIM35Q9UPQ4 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRIM35Q9UPQ4 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRIM35Q9UPQ4 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRIM35Q9UPQ4 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRIM35Q9UPQ4 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRIM35Q9UPQ4 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
TRIM35Q9UPQ4 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRIM35Q9UPQ4 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRIM35Q9UPQ4 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRIM35Q9UPQ4 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRIM35Q9UPQ4 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRIM35Q9UPQ4 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRIM35Q9UPQ4 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRIM35Q9UPQ4 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRIM35Q9UPQ4 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRIM35Q9UPQ4 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRIM35Q9UPQ4 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRIM35Q9UPQ4 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRIM35Q9UPQ4 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRIM35Q9UPQ4 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
TRIM35Q9UPQ4 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
TRIM35Q9UPQ4 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
TRIM35Q9UPQ4 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRIM35Q9UPQ4 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRIM35Q9UPQ4 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
TRIM35Q9UPQ4 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRIM35Q9UPQ4 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRIM35Q9UPQ4 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRIM35Q9UPQ4 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRIM35Q9UPQ4 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRIM35Q9UPQ4 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRIM35Q9UPQ4 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRIM35Q9UPQ4 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
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