Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULC6

PADI1, Protein-arginine deiminase type-1, humanhuman

Predictions only

Length 663 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PADI1Q9ULC6 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PADI1Q9ULC6 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PADI1Q9ULC6 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PADI1Q9ULC6 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PADI1Q9ULC6 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PADI1Q9ULC6 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PADI1Q9ULC6 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PADI1Q9ULC6 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PADI1Q9ULC6 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
PADI1Q9ULC6 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PADI1Q9ULC6 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PADI1Q9ULC6 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PADI1Q9ULC6 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PADI1Q9ULC6 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PADI1Q9ULC6 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
PADI1Q9ULC6 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PADI1Q9ULC6 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
PADI1Q9ULC6 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PADI1Q9ULC6 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
PADI1Q9ULC6 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
PADI1Q9ULC6 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PADI1Q9ULC6 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PADI1Q9ULC6 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PADI1Q9ULC6 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PADI1Q9ULC6 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PADI1Q9ULC6 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
PADI1Q9ULC6 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PADI1Q9ULC6 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PADI1Q9ULC6 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
PADI1Q9ULC6 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PADI1Q9ULC6 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PADI1Q9ULC6 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
PADI1Q9ULC6 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PADI1Q9ULC6 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PADI1Q9ULC6 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PADI1Q9ULC6 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PADI1Q9ULC6 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PADI1Q9ULC6 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PADI1Q9ULC6 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PADI1Q9ULC6 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PADI1Q9ULC6 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PADI1Q9ULC6 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PADI1Q9ULC6 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PADI1Q9ULC6 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PADI1Q9ULC6 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PADI1Q9ULC6 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PADI1Q9ULC6 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PADI1Q9ULC6 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PADI1Q9ULC6 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PADI1Q9ULC6 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PADI1Q9ULC6 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PADI1Q9ULC6 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PADI1Q9ULC6 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PADI1Q9ULC6 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PADI1Q9ULC6 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PADI1Q9ULC6 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PADI1Q9ULC6 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PADI1Q9ULC6 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PADI1Q9ULC6 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PADI1Q9ULC6 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PADI1Q9ULC6 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PADI1Q9ULC6 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PADI1Q9ULC6 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PADI1Q9ULC6 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PADI1Q9ULC6 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PADI1Q9ULC6 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PADI1Q9ULC6 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PADI1Q9ULC6 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PADI1Q9ULC6 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PADI1Q9ULC6 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PADI1Q9ULC6 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PADI1Q9ULC6 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PADI1Q9ULC6 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PADI1Q9ULC6 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PADI1Q9ULC6 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PADI1Q9ULC6 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PADI1Q9ULC6 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PADI1Q9ULC6 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PADI1Q9ULC6 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PADI1Q9ULC6 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PADI1Q9ULC6 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PADI1Q9ULC6 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PADI1Q9ULC6 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PADI1Q9ULC6 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PADI1Q9ULC6 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PADI1Q9ULC6 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PADI1Q9ULC6 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PADI1Q9ULC6 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PADI1Q9ULC6 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PADI1Q9ULC6 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PADI1Q9ULC6 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PADI1Q9ULC6 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PADI1Q9ULC6 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
PADI1Q9ULC6 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PADI1Q9ULC6 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PADI1Q9ULC6 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
PADI1Q9ULC6 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PADI1Q9ULC6 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PADI1Q9ULC6 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PADI1Q9ULC6 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.4 ms